RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 C21orf2O43822 256 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ANXA1P04083 346 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 MMP16P51512 607 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 EMP3P54852 163 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 RESTQ13127 1097 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC144BQ3MJ40 725 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC93Q567U6 631 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 LRP10Q7Z4F1 713 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 DNAJC10Q8IXB1 793 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ACSBG1Q96GR2 724 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 DNAI1Q9UI46 699 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.094e-7■■□□□ 13.6
CTPS1-201ENST00000372616 PALLDQ8WX93 1383 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 POTEB3A0JP26 581 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 SIK1P57059 783 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ETF1P62495 437 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ADCK5Q3MIX3 580 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ERFEQ4G0M1 354 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 POTEBQ6S5H4 581 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 FERMT3Q86UX7 667 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF687Q8N1G0 1237 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 DDX11Q96FC9 970 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 MPHOSPH8Q99549 860 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 BTAF1O14981 1849 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PQ27 194 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PQ64 194 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PQD8 194 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 TUBBP07437 444 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 IVLP07476 585 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 PTH1RQ03431 593 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 MSS51Q4VC12 460 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 KIF6Q6ZMV9 814 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 FAM196AQ6ZSG2 479 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 HOMER1Q86YM7 354 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 NBPF15Q8N660 670 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 FAM161BQ96MY7 647 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ASB16Q96NS5 453 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 DCTN4Q9UJW0 460 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 FHOD1Q9Y613 1164 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 NUP188Q5SRE5 1749 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 RREB1Q92766 1687 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 MED23Q9ULK4 1368 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 IKBKBO14920 756 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 A1BGP04217 495 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 PBX2P40425 430 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ST3GAL1Q11201 340 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 TUBB2AQ13885 445 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 USPL1Q5W0Q7 1092 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 KRT27Q7Z3Y8 459 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 NECAB1Q8N987 351 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 EXOC4Q96A65 974 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 PGBD1Q96JS3 809 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 TUBB2BQ9BVA1 445 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 RNF19AQ9NV58 838 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ERICH4A6NGS2 130 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 GRM8O00222 908 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA5Q8TBA6 731 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 KCNG4Q8TDN1 519 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 RASSF4Q9H2L5 321 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC87Q9NVE4 849 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 BRWD3Q6RI45 1802 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 LY75O60449 1722 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 UTYO14607 1347 aa8.25□□□□□ -1.09
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