RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371786.3

C9orf116-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 116, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf116, Length 612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116-201ENST00000371786 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 JAG1P78504 1218 aa20.86■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 ST3GAL1Q11201 340 aa20.86■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 TMEM179Q6ZVK1 233 aa20.86■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 USP48Q86UV5 1035 aa20.86■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 CCDC83Q8IWF9 413 aa20.86■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 ZNF654Q8IZM8 581 aa20.86■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 GTF3C6Q969F1 213 aa20.86■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 CABP5Q9NP86 173 aa20.86■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 ZBTB43O43298 467 aa20.85■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 GUCY1A2P33402 732 aa20.85■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 SCRN1Q12765 414 aa20.85■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.85■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.85■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 ZNF341Q9BYN7 854 aa20.85■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 KAT14Q9H8E8 782 aa20.85■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 STX8Q9UNK0 236 aa20.85■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.85■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 GH2P01242 217 aa20.84■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 CAP2P40123 477 aa20.84■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 RCAN1P53805 252 aa20.84■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 CCT2P78371 535 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 SEPT2Q15019 361 aa20.84■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 DLK2Q6UY11 383 aa20.84■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.84■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.84■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 MYL10Q9BUA6 226 aa20.84■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.84■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.84■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.84■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 TTLL1O95922 423 aa20.83■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 POTEIP0CG38 1075 aa20.83■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 POTEJP0CG39 1038 aa20.83■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 TOP1P11387 765 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP20.83■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 CDC37L1Q7L3B6 337 aa20.83■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.83■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.83■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 NMRK2Q9NPI5 230 aa20.83■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 NYAP2Q9P242 653 aa20.83■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.83■□□□□ 0.93
C9orf116-201ENST00000371786 SSC5DA1L4H1 1573 aa20.83■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 NID2Q14112 1375 aa20.83■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 GOLGA8AA7E2F4 631 aa20.82■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 DDAH1O94760 285 aa20.82■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 CALM1P0DP23 149 aa20.82■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 CALM2P0DP24 149 aa20.82■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 CALM3P0DP25 149 aa20.82■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 RXRAP19793 462 aa20.82■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 TROAPQ12815 778 aa20.82■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 MICU3Q86XE3 530 aa20.82■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 PNMA1Q8ND90 353 aa20.82■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.82■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.81■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.81■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 FANCBQ8NB91 859 aa20.81■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.81■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 MKL1Q969V6 931 aa20.81■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 CDCA5Q96FF9 252 aa20.81■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 GINM1Q9NU53 330 aa20.81■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 ASNSP08243 561 aa20.8■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 ICA1Q05084 483 aa20.8■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 PPP2R5BQ15173 497 aa20.8■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 LDHDQ86WU2 507 aa20.8■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa20.8■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 KLRG1Q96E93 195 aa20.8■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 USP2O75604 605 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 CDC27P30260 824 aa20.79■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 INPP5BP32019 993 aa20.79■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 ADD1P35611 737 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 ATP2B2Q01814 1243 aa20.79■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 RTN1Q16799 776 aa20.79■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 MAP3K14Q99558 947 aa20.79■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 FZD1Q9UP38 647 aa20.79■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.78■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 CTDNEP1O95476 244 aa20.78■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 NF2P35240 595 aa20.78■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 WRNIP1Q96S55 665 aa20.78■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.78■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 MYH4Q9Y623 1939 aa20.78■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa20.77■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 CPLX1O14810 134 aa20.77■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 PRKG1Q13976 671 aa20.77■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 GRM4Q14833 912 aa20.77■□□□□ 0.92
C9orf116-201ENST00000371786 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms