RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368210.7

PTPRK-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRK, Length 5,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-204ENST00000368210 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 FCHSD1Q86WN1 690 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 ADGRB3O60242 1522 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 MYZAPP0CAP1 466 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 SH2D4AQ9H788 454 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 LRWD1Q9UFC0 647 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 SLC1A4P43007 532 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 CCDC122Q5T0U0 273 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 LMNTD2Q8IXW0 634 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 TRIM14Q14142 442 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 CCDC6Q16204 474 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 STAMQ92783 540 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 EVCP57679 992 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 MFSD14BQ5SR56 506 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 HOOK3Q86VS8 718 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 ABCA6Q8N139 1617 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 ADCY7P51828 1080 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 UBE4AQ14139 1066 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 SERTAD1Q9UHV2 236 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 LMBR1Q8WVP7 490 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 E9PCH4 1651 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 BTBD18B2RXH4 712 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 CMA1P23946 247 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 PNOCQ13519 176 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 MED23Q9ULK4 1368 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 TCHPQ9BT92 498 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 CYP27B1O15528 508 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 KIF4AO95239 1232 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 PRPHP41219 470 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 NLRP10Q86W26 655 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 SNX29Q8TEQ0 813 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 ARHGAP6O43182 974 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 GTF2IP78347 998 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 DAAM2Q86T65 1068 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 MED14O60244 1454 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 KIF3CO14782 793 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 PLS1Q14651 629 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 USPL1Q5W0Q7 1092 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 NDUFAB1O14561 156 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 NECTIN1Q15223 517 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 FBF1Q8TES7 1133 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 H0YIN7 160 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 IGKV5-2P06315 115 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 MTX1Q13505 466 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 PNMA1Q8ND90 353 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 KRT9P35527 623 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 TCP10Q12799 353 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 APOA5Q6Q788 366 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 PI16Q6UXB8 463 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 AXIN2Q9Y2T1 843 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 NCAPD2Q15021 1401 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 RHOXF2BP0C7M4 288 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 OSBP2Q969R2 916 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 RHOXF2Q9BQY4 288 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 TAB2Q9NYJ8 693 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 CALCRLQ16602 461 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 C6orf163Q5TEZ5 329 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 CYP26C1Q6V0L0 522 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 PIGBQ92521 554 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRK-204ENST00000368210 H7C1W4 665 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 M0R2C6 588 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 ADD2P35612 726 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 PPP2R3AQ06190 1150 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 RAPGEF1Q13905 1077 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 CABP7Q86V35 215 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 IMPG2Q9BZV3 1241 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 POLD1P28340 1107 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 NEDD9Q14511 834 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 MCTP2Q6DN12 878 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 NCAPGQ9BPX3 1015 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 BLZF1Q9H2G9 400 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 QRICH2Q9H0J4 1663 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 SMCO2A6NFE2 343 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms