RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 CLRN2A0PK11 232 aa17.85■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 KIF28PB7ZC32 967 aa17.85■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 DDAH1O94760 285 aa17.85■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 KRT40Q6A162 431 aa17.85■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM87AQ8NBN3 555 aa17.85■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 CEP95Q96GE4 821 aa17.85■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 SIPA1L1O43166 1804 aa17.85■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 SPDYE2BA6NHP3 402 aa17.84■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 SPDYE6P0CI01 402 aa17.84■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 CALM1P0DP23 149 aa17.84■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 CALM2P0DP24 149 aa17.84■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 CALM3P0DP25 149 aa17.84■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 KRT85P78386 507 aa17.84■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 CIAPIN1Q6FI81 312 aa17.84■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP17.84■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 DNAJC18Q9H819 358 aa17.84■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 V9GY48 417 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 STK36Q9NRP7 1315 aa17.84■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 TCP10L2B9ZVM9 353 aa17.84■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 HLA-DOAP06340 250 aa17.84■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 PPP2R5BQ15173 497 aa17.84■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 DLGAP5Q15398 846 aa17.84■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 RASGRP2Q7LDG7 609 aa17.84■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 CLEC10AQ8IUN9 316 aa17.84■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 STAG2Q8N3U4 1231 aa17.84■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 OGFOD1Q8N543 542 aa17.84■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 SPON1Q9HCB6 807 aa17.84■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 HDAC9Q9UKV0 1011 aa17.84■□□□□ 0.45
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC178Q5BJE1 867 aa17.83■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 TRIM22Q8IYM9 498 aa17.83■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 AGBL3Q8NEM8 1001 aa17.83■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 PIBF1Q8WXW3 757 aa17.83■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 KCNJ14Q9UNX9 436 aa17.83■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 DEXIO95424 95 aa17.82■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 NT5C2P49902 561 aa17.82■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 EIF6P56537 245 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 PKN1Q16512 942 aa17.82■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 TMTC3Q6ZXV5 915 aa17.82■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 SHISA4Q96DD7 197 aa17.82■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 PI4KBQ9UBF8 816 aa17.82■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 SWAP70Q9UH65 585 aa17.82■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 MAD2L2Q9UI95 211 aa17.82■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa17.81■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 NPM3O75607 178 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 SPATA32Q96LK8 384 aa17.81■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 USP28Q96RU2 1077 aa17.81■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 MTMR4Q9NYA4 1195 aa17.81■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 ENTPD3O75355 529 aa17.8■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 GOLGA8HP0CJ92 632 aa17.8■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 NBPF9Q3BBW0 867 aa17.8■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 EHD4Q9H223 541 aa17.8■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM63CQ9P1W3 806 aa17.8■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa17.8■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 EGFRP00533 1210 aa17.8■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 DEKP35659 375 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 NOVP48745 357 aa17.8■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 GRM4Q14833 912 aa17.8■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 SLC35G1Q2M3R5 365 aa17.8■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 WASF1Q92558 559 aa17.8■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 CPVLQ9H3G5 476 aa17.8■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 VEZTQ9HBM0 779 aa17.8■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa17.79■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 UBE2HP62256 183 aa17.79■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 TRIM29Q14134 588 aa17.79■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 TNIP1Q15025 636 aa17.79■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 SPDYE2Q495Y8 402 aa17.79■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa17.79■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 VPS54Q9P1Q0 977 aa17.79■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 CLIP2Q9UDT6 1046 aa17.79■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 GJA3Q9Y6H8 435 aa17.79■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 LTBP3Q9NS15 1303 aa17.79■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 BTBD18B2RXH4 712 aa17.78■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 WNT10BO00744 389 aa17.78■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 TOP1P11387 765 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 USP17L2Q6R6M4 530 aa17.78■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 ILDR2Q71H61 639 aa17.78■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 CDAN1Q8IWY9 1227 aa17.78■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
CASQ1-201ENST00000368078 PGBD1Q96JS3 809 aa17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms