RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FBXO30Q8TB52 745 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMC2Q8TDI7 906 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TSKUQ8WUA8 353 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CLUHP3Q96NS8 147 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF382Q96SR6 550 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CDHR5Q9HBB8 845 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KCNH3Q9ULD8 1083 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RNF114Q9Y508 228 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VPS13AQ96RL7 3174 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ALPK3Q96L96 1907 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A1L4Q6 167 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WASHC1A8K0Z3 465 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WASH3PC4AMC7 463 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WNT10BO00744 389 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UGDHO60701 494 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LRP3O75074 770 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF205O95201 554 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TACSTD2P09758 323 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 H2BFMP0C1H6 154 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 INSRRP14616 1297 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MST1P26927 711 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCKBRP32239 447 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WASH2PQ6VEQ5 465 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CD93Q9NPY3 652 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNRF3Q9ULT6 936 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 XIRP2A4UGR9 3374 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC88CQ9P219 2028 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 M0R2T5 61 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZBTB39O15060 712 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ALX3O95076 343 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AVPP01185 164 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PROZP22891 400 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FASLGP48023 281 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WNT7BP56706 349 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM69CQ0P6D2 419 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAPK7Q13164 816 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PDE3BQ13370 1112 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 Q5BKY6 102 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LINC00242Q5T6M2 205 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM132EQ6IEE7 984 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 XKR5Q6UX68 686 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRIM63Q969Q1 353 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AKT1S1Q96B36 256 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CRAMP1Q96RY5 1269 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLITRK2Q9H156 845 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 USP20Q9Y2K6 914 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ASPMQ8IZT6 3477 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MED12Q93074 2177 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C2orf71A6NGG8 1288 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SHISA9B4DS77 424 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VEGFDO43915 354 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF32P17041 273 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CELP19835 753 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GLDCP23378 1020 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RGS3P49796 1198 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RASSF7Q02833 373 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAPKAPK3Q16644 382 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RNF212Q495C1 297 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ASPHD1Q5U4P2 390 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CREB3L3Q68CJ9 461 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PIANPQ8IYJ0 282 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EGFL8Q99944 293 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 U3KQA8 63 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C2orf16Q68DN1 1984 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DISP3Q9P2K9 1392 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MYO16Q9Y6X6 1858 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GRXCR1A8MXD5 290 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KDM4AO75164 1064 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CD300CQ08708 224 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MTA1Q13330 715 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SQSTM1Q13501 440 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SNAI3Q3KNW1 292 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KLHDC10Q6PID8 442 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGFL3Q6UXB1 125 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CHRDL2Q6WN34 429 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C20orf204Q6ZNR8 217 aa-2.45□□□□□ -2.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms