RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 C6orf229H3BNL8 230 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 LY75O60449 1722 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 ERICH2A1L162 156 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 DEXIO95424 95 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 ST5P78524 1137 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 USP17L8P0C7I0 530 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 POLLQ9UGP5 575 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 MYH6P13533 1939 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 RILPL1Q5EBL4 403 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 CTR9Q6PD62 1173 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 FANCBQ8NB91 859 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 F8W031 263 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 PTPREP23469 700 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF654Q8IZM8 581 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 MXD3Q9BW11 206 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 ANAPC4Q9UJX5 808 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 MYO1BO43795 1136 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 BMP6P22004 513 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 KIF18AQ8NI77 898 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 DPF2Q92785 391 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 OGFRQ9NZT2 677 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 UBASH3AP57075 661 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 SPECC1Q5M775 1068 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 DYNLL2Q96FJ2 89 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 GRIN1Q05586 938 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 SEC23AQ15436 765 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 MCM9Q9NXL9 1143 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1B0GUL6 1792 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 TNKSO95271 1327 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 XDHP47989 1333 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 FOXN1O15353 648 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 CBFA2T2O43439 604 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 UBAC1Q9BSL1 405 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 CACNA1SQ13698 1873 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 NR5A1Q13285 461 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC44A5Q8NCS7 719 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 MYH2Q9UKX2 1941 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 SERPINC1P01008 464 aa21.46■■□□□ 1.03
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SH3BP1-201ENST00000357436 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 LDHBP07195 334 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 PDE4BQ07343 736 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 NT5DC1Q5TFE4 455 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 FANCLQ9NW38 375 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 NRDCO43847 1150 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 MMP10P09238 476 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP2R5BQ15173 497 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-201ENST00000357436 CRY2Q49AN0 593 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 OXER1Q8TDS5 423 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 ESR2Q92731 530 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 SARSP49591 514 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 POSTNQ15063 836 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 VSTM4Q8IW00 320 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 TMX1Q9H3N1 280 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP2B1P20020 1258 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 DOK7Q18PE1 504 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 CFAP100Q494V2 611 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 ERO1AQ96HE7 468 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 CD209Q9NNX6 404 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 GGA1Q9UJY5 639 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 SHISA4Q96DD7 197 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 SERTAD1Q9UHV2 236 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 TBC1D16Q8TBP0 767 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 CEP131Q9UPN4 1083 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1-201ENST00000357436 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
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