RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 TUBB4AP04350 444 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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SPNS1-204ENST00000352260 COA1Q9GZY4 146 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 KIF28PB7ZC32 967 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 BTDP43251 543 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 LRMPQ12912 555 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 C12orf60Q5U649 245 aa21.41■■□□□ 1.02
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SPNS1-204ENST00000352260 NUP133Q8WUM0 1156 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa21.4■■□□□ 1.02
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SPNS1-204ENST00000352260 KRT40Q6A162 431 aa21.4■■□□□ 1.02
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SPNS1-204ENST00000352260 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 NAV1Q8NEY1 1877 aa21.4■■□□□ 1.02
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SPNS1-204ENST00000352260 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.39■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 NBPF11Q86T75 865 aa21.39■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.39■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 CERS3Q8IU89 383 aa21.39■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa21.39■■□□□ 1.02
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SPNS1-204ENST00000352260 KMT5BQ4FZB7 885 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 FAM47AQ5JRC9 791 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 LRRC8AQ8IWT6 810 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 BICD2Q8TD16 824 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
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SPNS1-204ENST00000352260 ZNF165P49910 485 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 MYSM1Q5VVJ2 828 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 SLF2Q8IX21 1173 aa21.38■■□□□ 1.01
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SPNS1-204ENST00000352260 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 CATIPQ7Z7H3 387 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
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SPNS1-204ENST00000352260 RHBDL3P58872 404 aa21.35■■□□□ 1.01
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SPNS1-204ENST00000352260 TSPY2A6NKD2 308 aa21.35■■□□□ 1.01
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SPNS1-204ENST00000352260 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.35■■□□□ 1.01
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SPNS1-204ENST00000352260 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
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SPNS1-204ENST00000352260 CALM3P0DP25 149 aa21.34■■□□□ 1.01
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SPNS1-204ENST00000352260 CERS5Q8N5B7 392 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 EYA3Q99504 573 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 YEATS4O95619 227 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS1-204ENST00000352260 KCNJ6P48051 423 aa21.33■■□□□ 1.01
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