RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345015.4

KCNQ1-203, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene KCNQ1, Length 304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-203ENST00000345015 SLURP2P0DP57 97 aa14.53□□□□□ -0.08
KCNQ1-203ENST00000345015 CYP2D6P10635 497 aa14.53□□□□□ -0.08
KCNQ1-203ENST00000345015 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
KCNQ1-203ENST00000345015 PPARAQ07869 468 aa14.53□□□□□ -0.08
KCNQ1-203ENST00000345015 LPAR1Q92633 364 aa14.53□□□□□ -0.08
KCNQ1-203ENST00000345015 ERO1AQ96HE7 468 aa14.53□□□□□ -0.08
KCNQ1-203ENST00000345015 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.52□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 ORC4O43929 436 aa14.52□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 TBC1D8O95759 1140 aa14.52□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 GUCY1A2P33402 732 aa14.52□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 JAG1P78504 1218 aa14.52□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 C17orf99Q6UX52 265 aa14.52□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 DYNLL2Q96FJ2 89 aa14.52□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa14.52□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 ADGRA2Q96PE1 1338 aa14.51□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 CAPN15O75808 1086 aa14.51□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 RASA1P20936 1047 aa14.51□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 OSBPP22059 807 aa14.51□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 CHMLP26374 656 aa14.51□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 HMGCS2P54868 508 aa14.51□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 SP3Q02447 781 aa14.51□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 MTMR2Q13614 643 aa14.51□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.51□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 NYAP2Q9P242 653 aa14.51□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 TSKSQ9UJT2 592 aa14.51□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 TMX2Q9Y320 296 aa14.51□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa14.5□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 PRMT2P55345 433 aa14.5□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 ICA1Q05084 483 aa14.5□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 SEPT2Q15019 361 aa14.5□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.5□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 LBX2Q6XYB7 198 aa14.5□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 GADL1Q6ZQY3 521 aa14.5□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa14.5□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.5□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.5□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 MKL1Q969V6 931 aa14.5□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 MYPNQ86TC9 1320 aa14.49□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.49□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 USP17L15C9J2P7 530 aa14.49□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.49□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 USP17L11C9JVI0 530 aa14.49□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 USP17L18D6R9N7 530 aa14.49□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 USP17L22D6RA61 530 aa14.49□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.49□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 USP17L19D6RCP7 530 aa14.49□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 USP17L20D6RJB6 530 aa14.49□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 BCRP11274 1271 aa14.49□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 AKR1B1P15121 316 aa14.49□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 USP17L24Q0WX57 530 aa14.49□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 KIF22Q14807 665 aa14.49□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 FAM110CQ1W6H9 321 aa14.49□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 VPS53Q5VIR6 699 aa14.49□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 FEZ1Q99689 392 aa14.49□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.49□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF213O14771 459 aa14.48□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 SGSM2O43147 1006 aa14.48□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 NOVP48745 357 aa14.48□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.48□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 CASC1Q6TDU7 716 aa14.48□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 STAG1Q8WVM7 1258 aa14.48□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 VCPKMTQ9H867 229 aa14.48□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 GOPCQ9HD26 462 aa14.48□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa14.48□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 HTTP42858 3142 aa14.48□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 WDR46O15213 610 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 TTLL1O95922 423 aa14.47□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 TSPY3P0CV98 308 aa14.47□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 TSPY8P0CW00 308 aa14.47□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 EVX2Q03828 476 aa14.47□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 AKNAD1Q5T1N1 836 aa14.47□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 TREML2Q5T2D2 321 aa14.47□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa14.47□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.47□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 TTC14Q96N46 770 aa14.47□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa14.47□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.47□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.47□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.47□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 MORF4L1Q9UBU8 362 aa14.47□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 A0A1W2PRG0 241 aa14.46□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 EEF2P13639 858 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 VCAM1P19320 739 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms