RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332859.10

SUMO3-201, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUMO3, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-201ENST00000332859 C8orf76Q96K31 380 aa23.36■■□□□ 1.33
SUMO3-201ENST00000332859 EHD4Q9H223 541 aa23.36■■□□□ 1.33
SUMO3-201ENST00000332859 KAT14Q9H8E8 782 aa23.36■■□□□ 1.33
SUMO3-201ENST00000332859 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SUMO3-201ENST00000332859 FOSBP53539 338 aa23.35■■□□□ 1.33
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SUMO3-201ENST00000332859 MAP3K14Q99558 947 aa23.31■■□□□ 1.32
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SUMO3-201ENST00000332859 MYH8P13535 1937 aa23.29■■□□□ 1.32
SUMO3-201ENST00000332859 DEXIO95424 95 aa23.29■■□□□ 1.32
SUMO3-201ENST00000332859 SHMT1P34896 483 aa23.29■■□□□ 1.32
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SUMO3-201ENST00000332859 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa23.28■■□□□ 1.32
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SUMO3-201ENST00000332859 SIPA1L1O43166 1804 aa23.28■■□□□ 1.32
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SUMO3-201ENST00000332859 AKR1B1P15121 316 aa23.27■■□□□ 1.32
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SUMO3-201ENST00000332859 CEP95Q96GE4 821 aa23.27■■□□□ 1.32
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SUMO3-201ENST00000332859 MYO1BO43795 1136 aa23.26■■□□□ 1.31
SUMO3-201ENST00000332859 PLEKHA8P1O95397 391 aa23.26■■□□□ 1.31
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SUMO3-201ENST00000332859 PRELPP51888 382 aa23.26■■□□□ 1.31
SUMO3-201ENST00000332859 FUT2Q10981 343 aa23.26■■□□□ 1.31
SUMO3-201ENST00000332859 GRM4Q14833 912 aa23.26■■□□□ 1.31
SUMO3-201ENST00000332859 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.26■■□□□ 1.31
SUMO3-201ENST00000332859 FAM173BQ6P4H8 233 aa23.26■■□□□ 1.31
SUMO3-201ENST00000332859 CCDC82Q8N4S0 544 aa23.26■■□□□ 1.31
SUMO3-201ENST00000332859 PDLIM2Q96JY6 352 aa23.26■■□□□ 1.31
SUMO3-201ENST00000332859 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa23.26■■□□□ 1.31
SUMO3-201ENST00000332859 CLRN2A0PK11 232 aa23.26■■□□□ 1.31
SUMO3-201ENST00000332859 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SUMO3-201ENST00000332859 UVSSAQ2YD98 709 aa23.26■■□□□ 1.31
SUMO3-201ENST00000332859 FKBP1CQ5VVH2 108 aa23.26■■□□□ 1.31
SUMO3-201ENST00000332859 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
SUMO3-201ENST00000332859 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
SUMO3-201ENST00000332859 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.25■■□□□ 1.31
SUMO3-201ENST00000332859 GNAQP50148 359 aa23.25■■□□□ 1.31
SUMO3-201ENST00000332859 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.25■■□□□ 1.31
SUMO3-201ENST00000332859 KRT40Q6A162 431 aa23.25■■□□□ 1.31
SUMO3-201ENST00000332859 FAM151AQ8WW52 585 aa23.25■■□□□ 1.31
SUMO3-201ENST00000332859 DNAJC18Q9H819 358 aa23.25■■□□□ 1.31
SUMO3-201ENST00000332859 MYOZ2Q9NPC6 264 aa23.25■■□□□ 1.31
SUMO3-201ENST00000332859 MTMR4Q9NYA4 1195 aa23.25■■□□□ 1.31
SUMO3-201ENST00000332859 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa23.24■■□□□ 1.31
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