RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 PNOCQ13519 176 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 VPS52Q8N1B4 723 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 HOOK2Q96ED9 719 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 TCP10L2B9ZVM9 353 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 FAM102BQ5T8I3 360 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 CTSWP56202 376 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 SMCO2A6NFE2 343 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 ALDH1B1P30837 517 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 RABEP2Q9H5N1 569 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 TNNI1P19237 187 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 TCIRG1Q13488 830 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 SCNN1DP51172 638 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 CASC4Q6P4E1 433 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 CERS3Q8IU89 383 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 GLG1Q92896 1179 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 CHL1O00533 1208 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 DOK7Q18PE1 504 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 LZTS2Q9BRK4 669 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
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PTPRM-201ENST00000332175 AOX1Q06278 1338 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 MFSD14BQ5SR56 506 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 NUP58Q9BVL2 599 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 CIB2O75838 187 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGEF16Q5VV41 709 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 KLHL30Q0D2K2 578 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 MLKLQ8NB16 471 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 HOXB7P09629 217 aa24.83■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 MTX1Q13505 466 aa24.83■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D31Q96DN5 1066 aa24.83■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP24.82■■□□□ 1.568e-9■■■□□ 15.5
PTPRM-201ENST00000332175 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 GYG1P46976 350 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 MIER3Q7Z3K6 550 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 RNF169Q8NCN4 708 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 STIM2Q9P246 746 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 FYB2Q5VWT5 728 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 FAM47CQ5HY64 1035 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC110Q8TBZ0 833 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 BEGAINQ9BUH8 593 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 GAS7O60861 476 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 CYP2J2P51589 502 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF75DP51815 510 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 SERTAD1Q9UHV2 236 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa24.82■■□□□ 1.56
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PTPRM-201ENST00000332175 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.81■■□□□ 1.56
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PTPRM-201ENST00000332175 BCRP11274 1271 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 NLRX1Q86UT6 975 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 CARD6Q9BX69 1037 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 PDE6BP35913 854 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 SDR42E1Q8WUS8 393 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 SLF1Q9BQI6 1058 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 STMN2Q93045 179 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 H7C1D1 291 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 KCNQ3O43525 872 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 AFAP1L1Q8TED9 768 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 TEKT1Q969V4 418 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 NLRC4Q9NPP4 1024 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 MAGEA1P43355 309 aa24.8■■□□□ 1.56
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PTPRM-201ENST00000332175 USP17L12C9JPN9 530 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 USP17L21D6R901 530 aa24.8■■□□□ 1.56
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PTPRM-201ENST00000332175 CCDC125Q86Z20 511 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 MED10Q9BTT4 135 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 TRPC6Q9Y210 931 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 TECP42680 631 aa24.79■■□□□ 1.56
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PTPRM-201ENST00000332175 RRAGAQ7L523 313 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA8HP0CJ92 632 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 BCAMP50895 628 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 IFT20Q8IY31 132 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC105Q8IYK2 499 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 DEPTORQ8TB45 409 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 NSMCE1Q8WV22 266 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
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