RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 CEP95Q96GE4 821 aa23.02■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 MYL10Q9BUA6 226 aa23.02■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 KAT14Q9H8E8 782 aa23.02■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 STX8Q9UNK0 236 aa23.02■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa23.02■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 WDR90Q96KV7 1748 aa23.02■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 PPP2R5BQ15173 497 aa23.01■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 MTMR4Q9NYA4 1195 aa23.01■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 RXRAP19793 462 aa23.01■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 GJB2P29033 226 aa23.01■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa23.01■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa23■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 IQCA1LA6NCM1 817 aa23■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 CPLX1O14810 134 aa23■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 CTDNEP1O95476 244 aa23■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 TROAPQ12815 778 aa23■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 RTN1Q16799 776 aa23■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM47Q9BQJ4 181 aa23■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 EPHX2P34913 555 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 FANCBQ8NB91 859 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 PNMA1Q8ND90 353 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 HOOK2Q96ED9 719 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 CDKL5O76039 1030 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 CDC27P30260 824 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 MAP3K14Q99558 947 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 MYH4Q9Y623 1939 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 JAK2O60674 1132 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 TTLL1O95922 423 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 CABP5Q9NP86 173 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 GDF11O95390 407 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 NUCB2P80303 420 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 KIF3AQ9Y496 699 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 NTRK3Q16288 839 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 DCAF15Q66K64 600 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 NYAP2Q9P242 653 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC71-201ENST00000321895 GH2P01242 217 aa22.95■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 PDCP20941 246 aa22.95■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 KIF5BP33176 963 aa22.95■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 DTNBO60941 627 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 IFNAR1P17181 557 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 GUCY1A2P33402 732 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 SEPT2Q15019 361 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 DDX11Q96FC9 970 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 POTECB2RU33 542 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 CAP2P40123 477 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 ICA1Q05084 483 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 GRM4Q14833 912 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 SULF1Q8IWU6 871 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 SYT1P21579 422 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 JAG1P78504 1218 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 MKL1Q969V6 931 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 GINM1Q9NU53 330 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 STK36Q9NRP7 1315 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 FDPSP14324 419 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 PKP1Q13835 747 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 MYH6P13533 1939 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 STX6O43752 255 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 ASNSP08243 561 aa22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms