RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311659.4

UBQLN3-201, Transcript of ubiquilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN3, Length 2,407 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN3-201ENST00000311659 ABCB6Q9NP58 842 aa9.65□□□□□ -0.86
UBQLN3-201ENST00000311659 VPS18Q9P253 973 aa9.65□□□□□ -0.86
UBQLN3-201ENST00000311659 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
UBQLN3-201ENST00000311659 IFNAR1P17181 557 aa9.65□□□□□ -0.86
UBQLN3-201ENST00000311659 GUCY1A2P33402 732 aa9.65□□□□□ -0.86
UBQLN3-201ENST00000311659 VSNL1P62760 191 aa9.65□□□□□ -0.86
UBQLN3-201ENST00000311659 MCM6Q14566 821 aa9.65□□□□□ -0.86
UBQLN3-201ENST00000311659 RILPL1Q5EBL4 403 aa9.65□□□□□ -0.86
UBQLN3-201ENST00000311659 SPATA1Q5VX52 437 aa9.65□□□□□ -0.86
UBQLN3-201ENST00000311659 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
UBQLN3-201ENST00000311659 IGSF22Q8N9C0 903 aa9.65□□□□□ -0.86
UBQLN3-201ENST00000311659 ISCA1Q9BUE6 129 aa9.65□□□□□ -0.86
UBQLN3-201ENST00000311659 SLC26A6Q9BXS9 759 aa9.65□□□□□ -0.86
UBQLN3-201ENST00000311659 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.86
UBQLN3-201ENST00000311659 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
UBQLN3-201ENST00000311659 ZBTB3Q9H5J0 574 aa9.65□□□□□ -0.86
UBQLN3-201ENST00000311659 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
UBQLN3-201ENST00000311659 ITIH6Q6UXX5 1313 aa9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 ERLIN1O75477 346 aa9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 TFRCP02786 760 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 GYPCP04921 128 aa9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 CD44P16070 742 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC57Q2TAC2 916 aa9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF569Q5MCW4 686 aa9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 KANK3Q6NY19 840 aa9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 USP49Q70CQ1 688 aa9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 C10orf67Q8IYJ2 551 aa9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 SEMA3EO15041 775 aa9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 A1BGP04217 495 aa9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 IVLP07476 585 aa9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 ARHGAP25P42331 645 aa9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 AMPD2Q01433 879 aa9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 CASP8Q14790 479 aa9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 UBE3CQ15386 1083 aa9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 SLC35F6Q8N357 371 aa9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC51Q96ER9 411 aa9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 EFCC1Q9HA90 598 aa9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 RSPH14Q9UHP6 348 aa9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 FAN1Q9Y2M0 1017 aa9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 TACC3Q9Y6A5 838 aa9.64□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 A0A087X0B3 334 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 CTAGE9A4FU28 777 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 ABL1P00519 1130 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 CSF1RP07333 972 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 CASP14P31944 242 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 ALX1Q15699 326 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 TMEM67Q5HYA8 995 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 PPFIBP1Q86W92 1011 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 WASF1Q92558 559 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 PLA2G12BQ9BX93 195 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 KCNJ14Q9UNX9 436 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 NOP2P46087 812 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 ERVK-24P63145 666 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 WWC2Q6AWC2 1192 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 WDR93Q6P2C0 686 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 FOXR1Q6PIV2 292 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 LEKR1Q6ZMV7 388 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 NFXL1Q6ZNB6 911 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 CNGA4Q8IV77 575 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 ACRBPQ8NEB7 543 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 FAM71BQ8TC56 605 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 CSRNP2Q9H175 543 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 INCENPQ9NQS7 918 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 ZSWIM5Q9P217 1185 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 MYO1AQ9UBC5 1043 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 SLC12A7Q9Y666 1083 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa9.63□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 LRP5O75197 1615 aa9.62□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF532Q9HCE3 1301 aa9.62□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 TUBBP07437 444 aa9.62□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 RHOXF2BP0C7M4 288 aa9.62□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 NR5A1Q13285 461 aa9.62□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP9.62□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 SEPT12Q8IYM1 358 aa9.62□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 CPLX3Q8WVH0 158 aa9.62□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 CTAGE1Q96RT6 745 aa9.62□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 RHOXF2Q9BQY4 288 aa9.62□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 WWC3Q9ULE0 1092 aa9.62□□□□□ -0.87
UBQLN3-201ENST00000311659 CTAGE15A4D2H0 777 aa9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms