RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 NUP133Q8WUM0 1156 aa24.21■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 GGA3Q9NZ52 723 aa24.21■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 CDAN1Q8IWY9 1227 aa24.21■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa24.21■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa24.2■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 CTDNEP1O95476 244 aa24.2■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 NUCB2P80303 420 aa24.2■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 TROAPQ12815 778 aa24.2■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP2R5BQ15173 497 aa24.2■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 RTN1Q16799 776 aa24.2■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.2■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 TEPSINQ96N21 525 aa24.2■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 MTMR4Q9NYA4 1195 aa24.2■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 SCN4AP35499 1836 aa24.19■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa24.19■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 PTPDC1A2A3K4 754 aa24.19■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 JAK2O60674 1132 aa24.19■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 CDKL5O76039 1030 aa24.19■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 NOVP48745 357 aa24.19■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 FANCBQ8NB91 859 aa24.19■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 PNMA1Q8ND90 353 aa24.19■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa24.19■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 CDC27P30260 824 aa24.19■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM47Q9BQJ4 181 aa24.19■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 DTNBO60941 627 aa24.18■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 TOP1P11387 765 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 ADD1P35611 737 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 ABCB5Q2M3G0 1257 aa24.18■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM179Q6ZVK1 233 aa24.18■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF3AQ9Y496 699 aa24.18■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa24.18■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 TTLL1O95922 423 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 MIGA2Q7L4E1 593 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX11Q96FC9 970 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 GDF11O95390 407 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 PDCP20941 246 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 MAP3K10Q02779 954 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM184AQ8NB25 1140 aa24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 MYH4Q9Y623 1939 aa24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 IQCA1LA6NCM1 817 aa24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 KANSL2Q9H9L4 492 aa24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 CABP5Q9NP86 173 aa24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 EPHX2P34913 555 aa24.15■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 PKP1Q13835 747 aa24.15■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 RAB3GAP1Q15042 981 aa24.15■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 HOOK2Q96ED9 719 aa24.15■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 MAP3K14Q99558 947 aa24.15■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 WDR90Q96KV7 1748 aa24.15■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 SYT1P21579 422 aa24.14■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 NTRK3Q16288 839 aa24.14■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 CLEC10AQ8IUN9 316 aa24.14■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
PACSIN3-201ENST00000298838 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 GH2P01242 217 aa24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF5BP33176 963 aa24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 STX6O43752 255 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 PPFIA3O75145 1194 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 IFNAR1P17181 557 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 ICA1Q05084 483 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 SEPT2Q15019 361 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 DCAF15Q66K64 600 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP2B2Q01814 1243 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 SULF1Q8IWU6 871 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM22Q8IYM9 498 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 PHKBQ93100 1093 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 NYAP2Q9P242 653 aa24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 STK36Q9NRP7 1315 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 ATAD5Q96QE3 1844 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 BRD1O95696 1058 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 FDPSP14324 419 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 GUCY1A2P33402 732 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 CAP2P40123 477 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 GRM4Q14833 912 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 MTMR7Q9Y216 660 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 TMTC3Q6ZXV5 915 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 EEF2P13639 858 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-201ENST00000298838 JAG1P78504 1218 aa24.1■■□□□ 1.45
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