RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FZD1Q9UP38 647 aa27.92■■■□□ 2.06
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa27.92■■■□□ 2.06
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DDX11L8A8MPP1 907 aa27.91■■■□□ 2.06
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADM5C9JUS6 153 aa27.91■■■□□ 2.06
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 STX8Q9UNK0 236 aa27.91■■■□□ 2.06
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZDHHC9Q9Y397 364 aa27.91■■■□□ 2.06
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC12A7Q9Y666 1083 aa27.91■■■□□ 2.06
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLIN4Q96Q06 1357 aa27.91■■■□□ 2.06
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 POTEIP0CG38 1075 aa27.9■■■□□ 2.06
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 POTEJP0CG39 1038 aa27.9■■■□□ 2.06
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF654Q8IZM8 581 aa27.9■■■□□ 2.06
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa27.9■■■□□ 2.06
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SMC3Q9UQE7 1217 aa27.9■■■□□ 2.06
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZBTB43O43298 467 aa27.89■■■□□ 2.06
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CDC27P30260 824 aa27.89■■■□□ 2.06
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GUCY1A2P33402 732 aa27.89■■■□□ 2.06
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RASGRP2Q7LDG7 609 aa27.89■■■□□ 2.06
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NUP133Q8WUM0 1156 aa27.89■■■□□ 2.06
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DCAF8L1A6NGE4 600 aa27.88■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TBC1D12O60347 775 aa27.88■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 JAK2O60674 1132 aa27.88■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CTDNEP1O95476 244 aa27.88■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DGKHQ86XP1 1220 aa27.88■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM47Q9BQJ4 181 aa27.88■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MTMR4Q9NYA4 1195 aa27.88■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa27.88■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SSC5DA1L4H1 1573 aa27.88■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IQCA1LA6NCM1 817 aa27.88■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BRD1O95696 1058 aa27.88■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GH2P01242 217 aa27.88■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAP3K10Q02779 954 aa27.88■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SEPT2Q15019 361 aa27.88■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ABCB5Q2M3G0 1257 aa27.88■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMTC2Q8N394 836 aa27.88■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC17Q96LX7 622 aa27.88■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RRAGCQ9HB90 399 aa27.88■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MTMR7Q9Y216 660 aa27.88■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADD1P35611 737 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NT5C2P49902 561 aa27.87■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GOLGA8AA7E2F4 631 aa27.86■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BAG4O95429 457 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ANKS1AQ92625 1134 aa27.86■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PHF20L1A8MW92 1017 aa27.85■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NOVP48745 357 aa27.85■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KAT14Q9H8E8 782 aa27.85■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PTMSP20962 102 aa27.85■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TROAPQ12815 778 aa27.85■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KRT26Q7Z3Y9 468 aa27.85■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CATIPQ7Z7H3 387 aa27.85■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PNMA1Q8ND90 353 aa27.85■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CLIP2Q9UDT6 1046 aa27.85■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATP2B2Q01814 1243 aa27.84■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa27.84■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SIAH1Q8IUQ4 282 aa27.84■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SULF1Q8IWU6 871 aa27.84■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 USP48Q86UV5 1035 aa27.83■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYH4Q9Y623 1939 aa27.83■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GJB2P29033 226 aa27.83■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRKG1Q13976 671 aa27.83■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM179Q6ZVK1 233 aa27.83■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DDX11Q96FC9 970 aa27.83■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NMRK2Q9NPI5 230 aa27.83■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TAOK2Q9UL54 1235 aa27.83■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GOLGA6L22H0YM25 854 aa27.82■■■□□ 2.04
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC178Q5BJE1 867 aa27.82■■■□□ 2.04
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FANCBQ8NB91 859 aa27.82■■■□□ 2.04
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa27.82■■■□□ 2.04
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATAD5Q96QE3 1844 aa27.82■■■□□ 2.04
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EEF2P13639 858 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 INPP5BP32019 993 aa27.81■■■□□ 2.04
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CAP2P40123 477 aa27.81■■■□□ 2.04
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RTN1Q16799 776 aa27.81■■■□□ 2.04
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa27.81■■■□□ 2.04
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PTPDC1A2A3K4 754 aa27.81■■■□□ 2.04
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TTLL1O95922 423 aa27.81■■■□□ 2.04
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TOP1P11387 765 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CLEC11AQ9Y240 323 aa27.81■■■□□ 2.04
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ICA1Q05084 483 aa27.8■■■□□ 2.04
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC82Q8N4S0 544 aa27.8■■■□□ 2.04
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CABP5Q9NP86 173 aa27.8■■■□□ 2.04
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NID2Q14112 1375 aa27.8■■■□□ 2.04
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DDAH1O94760 285 aa27.79■■■□□ 2.04
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NTRK3Q16288 839 aa27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms