RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290417.6

GFRA4-201, Transcript of GDNF family receptor alpha 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GFRA4, Length 1,427 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4-201ENST00000290417 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
GFRA4-201ENST00000290417 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP26.99■■□□□ 1.91
GFRA4-201ENST00000290417 USP17L2Q6R6M4 530 aa26.99■■□□□ 1.91
GFRA4-201ENST00000290417 C17orf99Q6UX52 265 aa26.99■■□□□ 1.91
GFRA4-201ENST00000290417 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
GFRA4-201ENST00000290417 ACER1Q8TDN7 264 aa26.99■■□□□ 1.91
GFRA4-201ENST00000290417 MKNK2Q9HBH9 465 aa26.99■■□□□ 1.91
GFRA4-201ENST00000290417 PNMA3Q9UL41 463 aa26.99■■□□□ 1.91
GFRA4-201ENST00000290417 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
GFRA4-201ENST00000290417 EMILIN3Q9NT22 766 aa26.99■■□□□ 1.91
GFRA4-201ENST00000290417 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa26.98■■□□□ 1.91
GFRA4-201ENST00000290417 HIP1O00291 1037 aa26.98■■□□□ 1.91
GFRA4-201ENST00000290417 OSBPP22059 807 aa26.98■■□□□ 1.91
GFRA4-201ENST00000290417 PPARAQ07869 468 aa26.98■■□□□ 1.91
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GFRA4-201ENST00000290417 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa26.98■■□□□ 1.91
GFRA4-201ENST00000290417 TRIM17Q9Y577 477 aa26.98■■□□□ 1.91
GFRA4-201ENST00000290417 CCDC171Q6TFL3 1326 aa26.97■■□□□ 1.91
GFRA4-201ENST00000290417 USP14P54578 494 aa26.97■■□□□ 1.91
GFRA4-201ENST00000290417 CLEC10AQ8IUN9 316 aa26.97■■□□□ 1.91
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GFRA4-201ENST00000290417 ICA1Q05084 483 aa26.96■■□□□ 1.91
GFRA4-201ENST00000290417 KIF22Q14807 665 aa26.96■■□□□ 1.91
GFRA4-201ENST00000290417 ABHD8Q96I13 439 aa26.96■■□□□ 1.91
GFRA4-201ENST00000290417 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.96■■□□□ 1.91
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GFRA4-201ENST00000290417 EFCC1Q9HA90 598 aa26.96■■□□□ 1.91
GFRA4-201ENST00000290417 ZNF287Q9HBT7 754 aa26.96■■□□□ 1.91
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GFRA4-201ENST00000290417 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
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GFRA4-201ENST00000290417 OTOP1Q7RTM1 612 aa26.95■■□□□ 1.9
GFRA4-201ENST00000290417 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
GFRA4-201ENST00000290417 A0A1W2PRG0 241 aa26.94■■□□□ 1.9
GFRA4-201ENST00000290417 PRDM1O75626 825 aa26.94■■□□□ 1.9
GFRA4-201ENST00000290417 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
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GFRA4-201ENST00000290417 ALX1Q15699 326 aa26.94■■□□□ 1.9
GFRA4-201ENST00000290417 IFFO2Q5TF58 517 aa26.94■■□□□ 1.9
GFRA4-201ENST00000290417 C12orf42Q96LP6 360 aa26.94■■□□□ 1.9
GFRA4-201ENST00000290417 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa26.94■■□□□ 1.9
GFRA4-201ENST00000290417 CAPN15O75808 1086 aa26.93■■□□□ 1.9
GFRA4-201ENST00000290417 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
GFRA4-201ENST00000290417 PDE4BQ07343 736 aa26.93■■□□□ 1.9
GFRA4-201ENST00000290417 ARHGEF6Q15052 776 aa26.93■■□□□ 1.9
GFRA4-201ENST00000290417 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
GFRA4-201ENST00000290417 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa26.93■■□□□ 1.9
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GFRA4-201ENST00000290417 CTDSPL2Q05D32 466 aa26.92■■□□□ 1.9
GFRA4-201ENST00000290417 KANSL2Q9H9L4 492 aa26.92■■□□□ 1.9
GFRA4-201ENST00000290417 VCAM1P19320 739 aa26.91■■□□□ 1.9
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GFRA4-201ENST00000290417 SIAH1Q8IUQ4 282 aa26.91■■□□□ 1.9
GFRA4-201ENST00000290417 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa26.91■■□□□ 1.9
GFRA4-201ENST00000290417 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP26.91■■□□□ 1.9
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GFRA4-201ENST00000290417 SKAP1Q86WV1 359 aa26.9■■□□□ 1.9
GFRA4-201ENST00000290417 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
GFRA4-201ENST00000290417 SH2D4AQ9H788 454 aa26.9■■□□□ 1.9
GFRA4-201ENST00000290417 PSMC4P43686 418 aa26.9■■□□□ 1.9
GFRA4-201ENST00000290417 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
GFRA4-201ENST00000290417 TMX2Q9Y320 296 aa26.9■■□□□ 1.9
GFRA4-201ENST00000290417 MYH4Q9Y623 1939 aa26.89■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 USP17L15C9J2P7 530 aa26.89■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 USP17L13C9JLJ4 530 aa26.89■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 USP17L11C9JVI0 530 aa26.89■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 USP17L18D6R9N7 530 aa26.89■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 USP17L22D6RA61 530 aa26.89■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 USP17L17D6RBQ6 530 aa26.89■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 USP17L19D6RCP7 530 aa26.89■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 USP17L20D6RJB6 530 aa26.89■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 CTGFP29279 349 aa26.89■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 USP17L24Q0WX57 530 aa26.89■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 INCENPQ9NQS7 918 aa26.89■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 ANAPC4Q9UJX5 808 aa26.89■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 ZMYM6O95789 1325 aa26.88■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 HERVK_113P62684 666 aa26.88■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 PTPN22Q9Y2R2 807 aa26.88■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 TSPY3P0CV98 308 aa26.87■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 TSPY8P0CW00 308 aa26.87■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 FAM110CQ1W6H9 321 aa26.87■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 FAM47AQ5JRC9 791 aa26.87■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa26.87■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa26.87■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 TRIM47Q96LD4 638 aa26.87■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 HPS5Q9UPZ3 1129 aa26.87■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 CCDC85CA6NKD9 419 aa26.86■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 CHMLP26374 656 aa26.86■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 HAND2P61296 217 aa26.86■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 TFAP4Q01664 338 aa26.86■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 VCPKMTQ9H867 229 aa26.86■■□□□ 1.89
GFRA4-201ENST00000290417 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.89
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