RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290295.7

HOXB13-201, Transcript of homeobox B13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB13, Length 3,467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13-201ENST00000290295 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 VSTM4Q8IW00 320 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 SENP2Q9HC62 589 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 NEDD4P46934 1319 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 MAP2K7O14733 419 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 LINC00301Q8NCQ3 95 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 DHX58Q96C10 678 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 NTSR2O95665 410 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 GUCY2CP25092 1073 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 UBE4AQ14139 1066 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 PTPN21Q16825 1174 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 HDXQ7Z353 690 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 PES1O00541 588 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 MYL5Q02045 173 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 PDE4BQ07343 736 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 ANKRD2Q9GZV1 360 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 CLGNO14967 610 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 ANTXR2P58335 489 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 BTBD18B2RXH4 712 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 NLRP5P59047 1200 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 PACS2Q86VP3 889 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 CABP5Q9NP86 173 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 ZMYM6O95789 1325 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 GSG1L2A8MUP6 293 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 TMEM232C9JQI7 657 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 ERLIN1O75477 346 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 LDHBP07195 334 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 CHMP4BP1P59074 171 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 CCDC102AQ96A19 550 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 RIMBP2O15034 1052 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 ZNF654Q8IZM8 581 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 HSD3B7Q9H2F3 369 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 TNKSO95271 1327 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 CDC27P30260 824 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 YEATS4O95619 227 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 FDPSP14324 419 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 HSP90B2PQ58FF3 399 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 FOXR1Q6PIV2 292 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 TMEM139Q8IV31 216 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 PPM1EQ8WY54 764 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 KIFC2Q96AC6 838 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 FAN1Q9Y2M0 1017 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 ALS2Q96Q42 1657 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 ABCC6O95255 1503 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 BAG3O95817 575 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 PRDX5P30044 214 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 KLHL10Q6JEL2 608 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 MICALL1Q8N3F8 863 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 CLIC6Q96NY7 704 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 POTEB2H3BUK9 544 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 UFL1O94874 794 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 PFKFB1P16118 471 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 FANCBQ8NB91 859 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 KAT14Q9H8E8 782 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 VPS54Q9P1Q0 977 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 MRC1P22897 1456 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXB13-201ENST00000290295 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXB13-201ENST00000290295 MARCH6O60337 910 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXB13-201ENST00000290295 STX10O60499 249 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXB13-201ENST00000290295 RPS6KA5O75582 802 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXB13-201ENST00000290295 RPS6KA4O75676 772 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXB13-201ENST00000290295 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
HOXB13-201ENST00000290295 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXB13-201ENST00000290295 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HOXB13-201ENST00000290295 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HOXB13-201ENST00000290295 BRD2P25440 801 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HOXB13-201ENST00000290295 MNAT1P51948 309 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXB13-201ENST00000290295 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXB13-201ENST00000290295 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXB13-201ENST00000290295 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
HOXB13-201ENST00000290295 NARFQ9UHQ1 456 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXB13-201ENST00000290295 SCN11AQ9UI33 1791 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms