RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266079.4

PRPF6-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF6, Length 3,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6-201ENST00000266079 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 PSMA5P28066 241 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 ZNF165P49910 485 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 TRDNQ13061 729 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 STK3Q13188 491 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 ELF2Q15723 593 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 HHIPL2Q6UWX4 724 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 GMLQ99445 158 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 CLSTN2Q9H4D0 955 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 FAM196BA6NMK8 535 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 USP27XA6NNY8 438 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 TNIP1Q15025 636 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 MICALL2Q8IY33 904 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 KCNB2Q92953 911 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 LTBP3Q9NS15 1303 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 RPS6KB1P23443 525 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 ST3GAL1Q11201 340 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 ZDHHC15Q96MV8 337 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 VPS33BQ9H267 617 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa14.55□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 FZD9O00144 591 aa14.54□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 KRT32Q14532 448 aa14.54□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 Q6ZUG5 572 aa14.54□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 BRF1Q92994 677 aa14.54□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 SERPINA10Q9UK55 444 aa14.54□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.54□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa14.54□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 SLU7O95391 586 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 PLCG2P16885 1265 aa14.54□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 CAPN2P17655 700 aa14.54□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 ALX1Q15699 326 aa14.54□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.54□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 AKNAD1Q5T1N1 836 aa14.54□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 DNAJC25Q9H1X3 360 aa14.54□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 ST7Q9NRC1 585 aa14.54□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 CYB5R4Q7L1T6 521 aa14.53□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 NCOA7Q8NI08 942 aa14.53□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 CAVIN2O95810 425 aa14.53□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 FERMT3Q86UX7 667 aa14.53□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 NECAB1Q8N987 351 aa14.53□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.53□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 ZNF446Q9NWS9 450 aa14.53□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.52□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 PRC1O43663 620 aa14.52□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 SPDYE6P0CI01 402 aa14.52□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 CYP2C19P33261 490 aa14.52□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 ME3Q16798 604 aa14.52□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 FAM173BQ6P4H8 233 aa14.52□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 SARM1Q6SZW1 724 aa14.52□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.52□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.52□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 MYOZ2Q9NPC6 264 aa14.52□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.52□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 AGBL3Q8NEM8 1001 aa14.52□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa14.52□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 SPATA32Q96LK8 384 aa14.52□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 SENP2Q9HC62 589 aa14.52□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 ZSWIM5Q9P217 1185 aa14.52□□□□□ -0.08
PRPF6-201ENST00000266079 WNT10BO00744 389 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF6-201ENST00000266079 SKILP12757 684 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF6-201ENST00000266079 RXRAP19793 462 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF6-201ENST00000266079 EPS15P42566 896 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF6-201ENST00000266079 ANTXR2P58335 489 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF6-201ENST00000266079 APOBRQ0VD83 1088 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF6-201ENST00000266079 ARID5BQ14865 1188 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF6-201ENST00000266079 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF6-201ENST00000266079 AMOTL1Q8IY63 956 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF6-201ENST00000266079 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PRPF6-201ENST00000266079 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.51□□□□□ -0.09
PRPF6-201ENST00000266079 NMT2O60551 498 aa14.51□□□□□ -0.09
PRPF6-201ENST00000266079 C12orf60Q5U649 245 aa14.51□□□□□ -0.09
PRPF6-201ENST00000266079 TSPYL1Q9H0U9 437 aa14.51□□□□□ -0.09
PRPF6-201ENST00000266079 MKNK2Q9HBH9 465 aa14.51□□□□□ -0.09
PRPF6-201ENST00000266079 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.51□□□□□ -0.09
PRPF6-201ENST00000266079 MTMR7Q9Y216 660 aa14.51□□□□□ -0.09
PRPF6-201ENST00000266079 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PRPF6-201ENST00000266079 PDCP20941 246 aa14.51□□□□□ -0.09
PRPF6-201ENST00000266079 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PRPF6-201ENST00000266079 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PRPF6-201ENST00000266079 TPCN1Q9ULQ1 816 aa14.51□□□□□ -0.09
PRPF6-201ENST00000266079 MAST2Q6P0Q8 1798 aa14.51□□□□□ -0.09
PRPF6-201ENST00000266079 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PRPF6-201ENST00000266079 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PRPF6-201ENST00000266079 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa14.5□□□□□ -0.09
PRPF6-201ENST00000266079 IQCB1Q15051 598 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms