RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 F6X3S4 739 aa8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 APBB1O00213 710 aa8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 BCRP11274 1271 aa8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 MX1P20591 662 aa8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 CRKP46108 304 aa8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 MOGSQ13724 837 aa8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 LAPTM4AQ15012 233 aa8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 G2E3Q7L622 706 aa8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 KIF2CQ99661 725 aa8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 SERPINA10Q9UK55 444 aa8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 PI4KAP2A4QPH2 592 aa8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 MAP3K7O43318 606 aa8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 ALDH1L1O75891 902 aa8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 DDX58O95786 925 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 PPATQ06203 517 aa8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 KIF1BPQ96EK5 621 aa8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 GPATCH3Q96I76 525 aa8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM205AQ6ZU69 1335 aa8.39□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 ATAD5Q96QE3 1844 aa8.39□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 FSD2A1L4K1 749 aa8.39□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 NEURL1BA8MQ27 555 aa8.39□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 GYG1P46976 350 aa8.39□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP4CP60510 307 aa8.39□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM32Q13049 653 aa8.39□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.39□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 ERC1Q8IUD2 1116 aa8.39□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 SSH3Q8TE77 659 aa8.39□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 PXYLP1Q8TE99 480 aa8.39□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 RUFY2Q8WXA3 655 aa8.39□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAAF4Q8WXU2 420 aa8.39□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.39□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 C11orf49Q9H6J7 331 aa8.39□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.39□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNH4Q9UQ05 1017 aa8.39□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa8.39□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 PFASO15067 1338 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 H7C1W4 665 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 LCE2BO14633 110 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 PRSS12P56730 875 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 NEXNQ0ZGT2 675 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 KSR2Q6VAB6 950 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 RILPL2Q969X0 211 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF341Q9BYN7 854 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 BRPF3Q9ULD4 1205 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 LOC285556D6RIA3 1793 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 SURF6O75683 361 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 PLA2G5P39877 138 aa8.37□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 IRF5Q13568 498 aa8.37□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHL40Q2TBA0 621 aa8.37□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 DCAF15Q66K64 600 aa8.37□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 GADL1Q6ZQY3 521 aa8.37□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa8.37□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.37□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 MYLIPQ8WY64 445 aa8.37□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 PLA2G12BQ9BX93 195 aa8.37□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 USP44Q9H0E7 712 aa8.37□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 TMOD2Q9NZR1 351 aa8.37□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 TTC41PQ6P2S7 1318 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 SALL3Q9BXA9 1300 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM265A0A087WTH1 108 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 C3orf80F5H4A9 247 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 HIP1O00291 1037 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 BAG4O95429 457 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 HMGCRP04035 888 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 CSF1RP07333 972 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 NCLP19338 710 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 CHMLP26374 656 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 CASP7P55210 303 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 TCP10Q12799 353 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 GCKRQ14397 625 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC26Q2I0M4 334 aa8.36□□□□□ -1.07
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