RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255476.2

RFXAP-201, Transcript of regulatory factor X associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RFXAP, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAP-201ENST00000255476 MTMR7Q9Y216 660 aa24.55■■□□□ 1.52
RFXAP-201ENST00000255476 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.55■■□□□ 1.52
RFXAP-201ENST00000255476 NFKBIEO00221 500 aa24.54■■□□□ 1.52
RFXAP-201ENST00000255476 UBE2HP62256 183 aa24.54■■□□□ 1.52
RFXAP-201ENST00000255476 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
RFXAP-201ENST00000255476 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.54■■□□□ 1.52
RFXAP-201ENST00000255476 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
RFXAP-201ENST00000255476 PPP2R5BQ15173 497 aa24.53■■□□□ 1.52
RFXAP-201ENST00000255476 NEDD1Q8NHV4 660 aa24.53■■□□□ 1.52
RFXAP-201ENST00000255476 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
RFXAP-201ENST00000255476 ANKS1AQ92625 1134 aa24.53■■□□□ 1.52
RFXAP-201ENST00000255476 NT5C2P49902 561 aa24.53■■□□□ 1.52
RFXAP-201ENST00000255476 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa24.53■■□□□ 1.52
RFXAP-201ENST00000255476 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.53■■□□□ 1.52
RFXAP-201ENST00000255476 GMLQ99445 158 aa24.53■■□□□ 1.52
RFXAP-201ENST00000255476 TMEM47Q9BQJ4 181 aa24.53■■□□□ 1.52
RFXAP-201ENST00000255476 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
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RFXAP-201ENST00000255476 TMTC3Q6ZXV5 915 aa24.52■■□□□ 1.52
RFXAP-201ENST00000255476 CEP95Q96GE4 821 aa24.52■■□□□ 1.52
RFXAP-201ENST00000255476 USP28Q96RU2 1077 aa24.52■■□□□ 1.52
RFXAP-201ENST00000255476 VPS33BQ9H267 617 aa24.52■■□□□ 1.52
RFXAP-201ENST00000255476 DEXIO95424 95 aa24.52■■□□□ 1.52
RFXAP-201ENST00000255476 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
RFXAP-201ENST00000255476 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.52■■□□□ 1.52
RFXAP-201ENST00000255476 IDI2Q9BXS1 227 aa24.52■■□□□ 1.52
RFXAP-201ENST00000255476 V9GY48 417 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
RFXAP-201ENST00000255476 SIPA1L1O43166 1804 aa24.52■■□□□ 1.52
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RFXAP-201ENST00000255476 AKR1B1P15121 316 aa24.51■■□□□ 1.51
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RFXAP-201ENST00000255476 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa24.51■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa24.51■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa24.51■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.51■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 KCNJ14Q9UNX9 436 aa24.51■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 TRIM29Q14134 588 aa24.51■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 WASF1Q92558 559 aa24.51■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 MYO3BQ8WXR4 1341 aa24.51■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 HLA-DOAP06340 250 aa24.5■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 SHMT1P34896 483 aa24.5■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC178Q5BJE1 867 aa24.5■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 CLEC10AQ8IUN9 316 aa24.5■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 STAG2Q8N3U4 1231 aa24.5■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 ELP1O95163 1332 aa24.5■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 PKN1Q16512 942 aa24.5■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 PIBF1Q8WXW3 757 aa24.5■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 DNAJC18Q9H819 358 aa24.5■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 CFAP45Q9UL16 551 aa24.5■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 GAS2L3Q86XJ1 694 aa24.49■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 SHISA4Q96DD7 197 aa24.49■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa24.49■■□□□ 1.51
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RFXAP-201ENST00000255476 SPDYE2BA6NHP3 402 aa24.48■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 SPDYE6P0CI01 402 aa24.48■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
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RFXAP-201ENST00000255476 JDP2Q8WYK2 163 aa24.48■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 MYSM1Q5VVJ2 828 aa24.47■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 PGBD1Q96JS3 809 aa24.47■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
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RFXAP-201ENST00000255476 SWAP70Q9UH65 585 aa24.47■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 BRAPQ7Z569 592 aa24.47■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 VPS54Q9P1Q0 977 aa24.47■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
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RFXAP-201ENST00000255476 SHTN1A0MZ66 631 aa24.46■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 MMP1P03956 469 aa24.46■■□□□ 1.51
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RFXAP-201ENST00000255476 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 KIF5BP33176 963 aa24.46■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 PRELPP51888 382 aa24.46■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 GRM4Q14833 912 aa24.46■■□□□ 1.51
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RFXAP-201ENST00000255476 BTBD18B2RXH4 712 aa24.45■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 TCP10L2B9ZVM9 353 aa24.45■■□□□ 1.51
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RFXAP-201ENST00000255476 PI4KBQ9UBF8 816 aa24.45■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 RCOR1Q9UKL0 485 aa24.45■■□□□ 1.51
RFXAP-201ENST00000255476 PLIN4Q96Q06 1357 aa24.45■■□□□ 1.5
RFXAP-201ENST00000255476 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
RFXAP-201ENST00000255476 CIAPIN1Q6FI81 312 aa24.45■■□□□ 1.5
RFXAP-201ENST00000255476 SYCE3A1L190 88 aa24.44■■□□□ 1.5
RFXAP-201ENST00000255476 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP24.44■■□□□ 1.53e-6■■□□□ 13.8
RFXAP-201ENST00000255476 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
RFXAP-201ENST00000255476 AGBL3Q8NEM8 1001 aa24.44■■□□□ 1.5
RFXAP-201ENST00000255476 FSD2A1L4K1 749 aa24.44■■□□□ 1.5
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