RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254976.6

SNAP25-201, Transcript of synaptosome associated protein 25, humanhuman

APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAP25, Length 2,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25-201ENST00000254976 PNMA1Q8ND90 353 aa14.98□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.98□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.98□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 KAT14Q9H8E8 782 aa14.98□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa14.98□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 TCP10L2B9ZVM9 353 aa14.97□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 DDAH1O94760 285 aa14.97□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 DLGAP5Q15398 846 aa14.97□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 OGFOD1Q8N543 542 aa14.97□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 CEP95Q96GE4 821 aa14.97□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.97□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa14.97□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 HLA-DOAP06340 250 aa14.97□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 FUT2Q10981 343 aa14.97□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 AGBL3Q8NEM8 1001 aa14.97□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 ANKS1AQ92625 1134 aa14.97□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 SBF1O95248 1867 aa14.96□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 KIF28PB7ZC32 967 aa14.96□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 CALM1P0DP23 149 aa14.96□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 CALM2P0DP24 149 aa14.96□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 CALM3P0DP25 149 aa14.96□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 PTMSP20962 102 aa14.96□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 EIF6P56537 245 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 STAG2Q8N3U4 1231 aa14.96□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 STK36Q9NRP7 1315 aa14.96□□□□□ -0.01
SNAP25-201ENST00000254976 EGFRP00533 1210 aa14.96□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 KLHL40Q2TBA0 621 aa14.96□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 KRT40Q6A162 431 aa14.96□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.96□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 PIBF1Q8WXW3 757 aa14.96□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 LTBP3Q9NS15 1303 aa14.95□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 KRT85P78386 507 aa14.95□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.95□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.95□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 TMEM87AQ8NBN3 555 aa14.95□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 SHISA4Q96DD7 197 aa14.95□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.95□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 SWAP70Q9UH65 585 aa14.95□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 NT5C2P49902 561 aa14.94□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 GSE1Q14687 1217 aa14.94□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 PKN1Q16512 942 aa14.94□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 EHD4Q9H223 541 aa14.94□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 VEZTQ9HBM0 779 aa14.94□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 KCNJ14Q9UNX9 436 aa14.94□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.94□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.94□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 DEXIO95424 95 aa14.94□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 GOLGA8HP0CJ92 632 aa14.94□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 PPP2R5BQ15173 497 aa14.94□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.94□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa14.94□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.94□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.94□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 CNTNAP1P78357 1384 aa14.93□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.93□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.93□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 WNT10BO00744 389 aa14.93□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 ENTPD3O75355 529 aa14.93□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 TNIP1Q15025 636 aa14.93□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 SLC35G1Q2M3R5 365 aa14.93□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.93□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 CPVLQ9H3G5 476 aa14.93□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 MYOZ2Q9NPC6 264 aa14.93□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.93□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 MAD2L2Q9UI95 211 aa14.93□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 FZD9O00144 591 aa14.93□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 NOVP48745 357 aa14.93□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 GRM4Q14833 912 aa14.93□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 USP28Q96RU2 1077 aa14.93□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 CSRNP1Q96S65 589 aa14.93□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 TMOD2Q9NZR1 351 aa14.93□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.92□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SNAP25-201ENST00000254976 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms