RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253462.7

GINS2-201, Transcript of GINS complex subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS2, Length 2,673 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2-201ENST00000253462 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa18.55■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 PARP3Q9Y6F1 533 aa18.55■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 RCAN1P53805 252 aa18.54■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 SLC39A14Q15043 492 aa18.54■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP18.54■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 ISM2Q6H9L7 571 aa18.54■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 MKNK2Q9HBH9 465 aa18.54■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 ANO10Q9NW15 660 aa18.54■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 VPS54Q9P1Q0 977 aa18.54■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 ZBTB22O15209 634 aa18.54■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 PPP4CP60510 307 aa18.54■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 DPCR1Q3MIW9 517 aa18.54■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 NOSTRINQ8IVI9 506 aa18.54■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 OXER1Q8TDS5 423 aa18.54■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 DOK7Q18PE1 504 aa18.53■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 LRRC8AQ8IWT6 810 aa18.53■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 SHISA4Q96DD7 197 aa18.53■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 CAVIN2O95810 425 aa18.53■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 TNNT1P13805 278 aa18.53■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 ATP2B1P20020 1258 aa18.53■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 SARM1Q6SZW1 724 aa18.53■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 TEX11Q8IYF3 940 aa18.53■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP18.53■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 MXD3Q9BW11 206 aa18.53■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 MTMR7Q9Y216 660 aa18.53■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 A0A1W2PQ27 194 aa18.52■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 A0A1W2PQ64 194 aa18.52■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 A0A1W2PQD8 194 aa18.52■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 USP17L3A6NCW0 530 aa18.52■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 USP17L4A6NCW7 530 aa18.52■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 NPR1P16066 1061 aa18.52■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 PKN1Q16512 942 aa18.52■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 USP17L1Q7RTZ2 530 aa18.52■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 AMOTL1Q8IY63 956 aa18.52■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 MAP3K14Q99558 947 aa18.52■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 IL17RBQ9NRM6 502 aa18.52■□□□□ 0.56
GINS2-201ENST00000253462 FUT2Q10981 343 aa18.52■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 PTPAQ15257 358 aa18.52■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 RCSD1Q6JBY9 416 aa18.52■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 CEP57L1Q8IYX8 460 aa18.52■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 RGS22Q8NE09 1264 aa18.52■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa18.52■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 CLIC6Q96NY7 704 aa18.52■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 CDC25BP30305 580 aa18.51■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 PPP2R5BQ15173 497 aa18.51■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 DLEC1Q9Y238 1755 aa18.51■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa18.51■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa18.51■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 CALM1P0DP23 149 aa18.51■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 CALM2P0DP24 149 aa18.51■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 CALM3P0DP25 149 aa18.51■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 ZNF592Q92610 1267 aa18.51■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 NAV1Q8NEY1 1877 aa18.5■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 DDAH1O94760 285 aa18.5■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 PDE6BP35913 854 aa18.5■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 KIAA1468Q9P260 1216 aa18.5■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 LTBP1Q14766 1721 aa18.5■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 ZNF202O95125 648 aa18.5■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 TSPY3P0CV98 308 aa18.5■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 TSPY8P0CW00 308 aa18.5■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 PFKFB1P16118 471 aa18.5■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 ALDH1B1P30837 517 aa18.5■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 TMTC3Q6ZXV5 915 aa18.5■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 TMC4Q7Z404 712 aa18.5■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa18.5■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 CABP5Q9NP86 173 aa18.5■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 LRRC37AA6NMS7 1700 aa18.5■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 SKILP12757 684 aa18.49■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 FLAD1Q8NFF5 587 aa18.49■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 KAT14Q9H8E8 782 aa18.49■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 FAM205CA6NFA0 338 aa18.49■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 RHBDL3P58872 404 aa18.49■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 SPECC1Q5M775 1068 aa18.49■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 PRDM10Q9NQV6 1147 aa18.49■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 G3V3G9 751 aa18.48■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 CMA1P23946 247 aa18.48■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 DCAF8Q5TAQ9 597 aa18.48■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 SHC4Q6S5L8 630 aa18.48■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 CERS5Q8N5B7 392 aa18.48■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 MASTLQ96GX5 879 aa18.48■□□□□ 0.55
GINS2-201ENST00000253462 COA1Q9GZY4 146 aa18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms