RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249700.8

TMOD2-201, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD2, Length 9,191 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-201ENST00000249700 A0A1W2PQD8 194 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD2-201ENST00000249700 ATP1A3P13637 1013 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD2-201ENST00000249700 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.3
TMOD2-201ENST00000249700 GOLGA8FQ08AF8 430 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD2-201ENST00000249700 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD2-201ENST00000249700 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
TMOD2-201ENST00000249700 RILPL1Q5EBL4 403 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD2-201ENST00000249700 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD2-201ENST00000249700 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
TMOD2-201ENST00000249700 GPSM2P81274 684 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD2-201ENST00000249700 GRIN1Q05586 938 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD2-201ENST00000249700 CCDC96Q2M329 555 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD2-201ENST00000249700 USP49Q70CQ1 688 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD2-201ENST00000249700 DISP2A7MBM2 1401 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD2-201ENST00000249700 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 KRT27Q7Z3Y8 459 aa6.9□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.9□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 TMX1Q9H3N1 280 aa6.9□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 LRRC4BQ9NT99 713 aa6.9□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 GRIK5Q16478 980 aa6.9□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 XDHP47989 1333 aa6.9□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa6.9□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 CMA1P23946 247 aa6.9□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 KIF5BP33176 963 aa6.9□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 SOGA3Q5TF21 947 aa6.9□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.9□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 PNMA1Q8ND90 353 aa6.9□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 KIAA1468Q9P260 1216 aa6.9□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 UBA5Q9GZZ9 404 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 STAG1Q8WVM7 1258 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 MXD3Q9BW11 206 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 FAM196BA6NMK8 535 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 WDR66Q8TBY9 1149 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 BLZF1Q9H2G9 400 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 GSTO1P78417 241 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 TCP10Q12799 353 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 ZNF354CQ86Y25 554 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 EPSTI1Q96J88 318 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 LTN1O94822 1766 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 KRT2P35908 639 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 TXNRD1Q16881 649 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 KIAA0825Q8IV33 1275 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 FUCA2Q9BTY2 467 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 MMP1P03956 469 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 ATL3Q6DD88 541 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 BRIP1Q9BX63 1249 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 DBNDD1Q9H9R9 158 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 V9GYY5 206 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 NAPAP54920 295 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 TTC38Q5R3I4 469 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 SALL1Q9NSC2 1324 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 SHC4Q6S5L8 630 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 MMP10P09238 476 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 SLURP2P0DP57 97 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 NTRK3Q16288 839 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 TNNI2P48788 182 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 LONRF3Q496Y0 759 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 INF2Q27J81 1249 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 SMARCE1Q969G3 411 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 EVCP57679 992 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 RGS22Q8NE09 1264 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 ENGASEQ8NFI3 743 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 ZNF384Q8TF68 577 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 EEF2KMTQ96G04 330 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 COMMD10Q9Y6G5 202 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 PRKG1Q13976 671 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 EYA3Q99504 573 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 CUTAO60888 179 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 RRAGBQ5VZM2 374 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD2-201ENST00000249700 KRBA2Q6ZNG9 492 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms