RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221138.8

PPP2CB-201, Transcript of protein phosphatase 2 catalytic subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP2CB, Length 2,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2CB-201ENST00000221138 TOMM22Q9NS69 142 aa35.13■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 TOP1P11387 765 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 PDE4BQ07343 736 aa35.13■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa35.13■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 UBAC1Q9BSL1 405 aa35.13■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 TM4SF1P30408 202 aa35.12■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 ETF1P62495 437 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 CHRNDQ07001 517 aa35.12■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 MORC3Q14149 939 aa35.12■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 NYXQ9GZU5 481 aa35.12■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 ZNF18P17022 549 aa35.11■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 ERFEQ4G0M1 354 aa35.11■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 SYT10Q6XYQ8 523 aa35.11■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 ESR2Q92731 530 aa35.11■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 FOXN1O15353 648 aa35.11■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 SPATA20Q8TB22 786 aa35.11■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 PRDM10Q9NQV6 1147 aa35.11■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa35.11■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 SMARCE1Q969G3 411 aa35.1■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 INTS13Q9NVM9 706 aa35.1■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 CASZ1Q86V15 1759 aa35.1■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 MYH2Q9UKX2 1941 aa35.1■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 CYP7A1P22680 504 aa35.1■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 GRIN1Q05586 938 aa35.1■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 TPTE2Q6XPS3 522 aa35.1■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 NLGN1Q8N2Q7 840 aa35.1■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 MIGA1Q8NAN2 632 aa35.1■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 TAOK2Q9UL54 1235 aa35.1■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 NR5A1Q13285 461 aa35.09■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 SERTAD1Q9UHV2 236 aa35.09■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 ARHGAP6O43182 974 aa35.08■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 PCP11498 1178 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 KMT5BQ4FZB7 885 aa35.08■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 PKNOX2Q96KN3 472 aa35.08■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 TNKSO95271 1327 aa35.08■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 XBP1P17861 261 aa35.08■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 SPECC1Q5M775 1068 aa35.08■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 ILDR2Q71H61 639 aa35.08■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 TMEM139Q8IV31 216 aa35.08■■■■□ 3.21
PPP2CB-201ENST00000221138 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa35.07■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 TMEM232C9JQI7 657 aa35.07■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 ELF2Q15723 593 aa35.07■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP35.07■■■■□ 3.21e-7■■□□□ 11.9
PPP2CB-201ENST00000221138 COL4A1P02462 1669 aa35.07■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 ADGRA1Q86SQ6 560 aa35.06■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 NUP133Q8WUM0 1156 aa35.06■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 ZSCAN12O43309 604 aa35.06■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 PRR29P0C7W0 189 aa35.06■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP35.06■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 TRIM65Q6PJ69 517 aa35.05■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 REXO1L1PQ8IX06 675 aa35.05■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 OXER1Q8TDS5 423 aa35.05■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 CCDC34Q96HJ3 373 aa35.05■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 BRIP1Q9BX63 1249 aa35.05■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 BMP15O95972 392 aa35.05■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 FGRP09769 529 aa35.05■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 DDR1Q08345 913 aa35.05■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 FUT2Q10981 343 aa35.05■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa35.05■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP35.04■■■■□ 3.24e-17■□□□□ 8.9
PPP2CB-201ENST00000221138 SLC10A5Q5PT55 438 aa35.04■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 HOMER1Q86YM7 354 aa35.04■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 PHF20Q9BVI0 1012 aa35.04■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 FAM53CQ9NYF3 392 aa35.04■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa35.03■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 NPHP1O15259 732 aa35.03■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 SERPINB2P05120 415 aa35.03■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 UBE4AQ14139 1066 aa35.03■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 MSL1Q68DK7 614 aa35.03■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa35.03■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 CCDC24Q8N4L8 307 aa35.03■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 TRIM75PA6NK02 468 aa35.03■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 PLCD1P51178 756 aa35.03■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 PKN1Q16512 942 aa35.03■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP35.03■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 CSRNP2Q9H175 543 aa35.03■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 CABP5Q9NP86 173 aa35.03■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 LAMB1P07942 1786 aa35.02■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 CCDC82Q8N4S0 544 aa35.02■■■■□ 3.2
PPP2CB-201ENST00000221138 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
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