RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Angel2Q8K1C0 544 aa10.66□□□□□ -0.7
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kcnq3Q8K3F6 873 aa10.66□□□□□ -0.7
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gimap7Q8R379 293 aa10.66□□□□□ -0.7
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Stk38Q91VJ4 465 aa10.66□□□□□ -0.7
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lmbr1Q9JIT0 490 aa10.66□□□□□ -0.7
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hmgn5Q9JL35 406 aa10.66□□□□□ -0.7
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Suclg2Q9Z2I8 433 aa10.66□□□□□ -0.7
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AU015836B2RUM3 263 aa10.65□□□□□ -0.7
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cspp1B2RX88 1205 aa10.65□□□□□ -0.7
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 DnttP09838 530 aa10.65□□□□□ -0.7
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mmp14P53690 582 aa10.65□□□□□ -0.7
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc27a1Q60714 646 aa10.65□□□□□ -0.7
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Glis3Q6XP49 780 aa10.65□□□□□ -0.7
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hook1Q8BIL5 728 aa10.65□□□□□ -0.7
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Plekhg6Q8R0J1 787 aa10.65□□□□□ -0.7
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hps4Q99KG7 671 aa10.65□□□□□ -0.7
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Myh13B1AR69 1938 aa10.64□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 A0A1L1SQF0 893 aa10.64□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyp26c1B2RXA7 518 aa10.64□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zscan18E9PUD6 809 aa10.64□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Bnip3O55003 187 aa10.64□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 LdhaP06151 332 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 EzrP26040 586 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pou3f3P31361 497 aa10.64□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cfap157Q0VFX2 523 aa10.64□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 DSCC1Q14AI0 399 aa10.64□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam178bQ24JP3 464 aa10.64□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trappc10Q3TLI0 1259 aa10.64□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Psmd1Q3TXS7 953 aa10.64□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Usp28Q5I043 1051 aa10.64□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tekt3Q6X6Z7 490 aa10.64□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ptrh1Q8BW00 204 aa10.64□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tspyl4Q8VD63 406 aa10.64□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 ParnQ8VDG3 624 aa10.64□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nop2Q922K7 793 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Calml3Q9D6P8 149 aa10.64□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sytl4Q9R0Q1 673 aa10.64□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prr14lE9Q7C4 1971 aa10.63□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ifi207E9Q3L4 978 aa10.63□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Eddm13E9Q7F5 164 aa10.63□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Api5O35841 504 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Abl1P00520 1123 aa10.63□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Il4rP16382 810 aa10.63□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 GmpsQ3THK7 693 aa10.63□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lins1Q3U1D0 764 aa10.63□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kmt5bQ3U8K7 883 aa10.63□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ddx31Q6NZQ2 687 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc93Q7TQK5 629 aa10.63□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lca5Q80ST9 704 aa10.63□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ranbp6Q8BIV3 1105 aa10.63□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kiaa1524Q8BWY9 907 aa10.63□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc150Q8CDI7 1110 aa10.63□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Col26a1Q91VF6 440 aa10.63□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Krt23Q99PS0 422 aa10.63□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ankrd1Q9CR42 319 aa10.63□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rai14Q9EP71 979 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Klf15Q9EPW2 415 aa10.63□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Add3Q9QYB5 706 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lama2Q60675 3118 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Frmpd4A2AFR3 1320 aa10.62□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ktn1Q61595 1327 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zkscan7E9PVW1 718 aa10.62□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cfap73J3QPZ5 306 aa10.62□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SlkO54988 1233 aa10.62□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dnajc2P54103 621 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rasa2P58069 847 aa10.62□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hspa8P63017 646 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Terf1P70371 421 aa10.62□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ankrd13cQ3UX43 541 aa10.62□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Scnn1aQ61180 699 aa10.62□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Myl10Q62082 202 aa10.62□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CbarpQ66L44 698 aa10.62□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pdcl2Q78Y63 240 aa10.62□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Otop3Q80UF9 577 aa10.62□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trim29Q8R2Q0 587 aa10.62□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gtf2iQ9ESZ8 998 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rcan3Q9JKK0 239 aa10.62□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SmapQ9R0P4 181 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Clip2Q9Z0H8 1047 aa10.62□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Myh2G3UW82 1942 aa10.62□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Col2a1P28481 1487 aa10.61□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dock5B2RY04 1868 aa10.61□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SisF8VQM5 1818 aa10.61□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Psme4Q5SSW2 1843 aa10.61□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dhx8A2A4P0 1244 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pfkfb3A7UAK5 555 aa10.61□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm973E9Q295 1059 aa10.61□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sema3fO88632 785 aa10.61□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tyro3P55144 880 aa10.61□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 RubcnQ80U62 956 aa10.61□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Acnat2Q8BGG9 420 aa10.61□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tcp11l1Q8BTG3 509 aa10.61□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Myl6bQ8CI43 207 aa10.61□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Shtn1Q8K2Q9 631 aa10.61□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Arhgef6Q8K4I3 771 aa10.61□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nup133Q8R0G9 1155 aa10.61□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cdk8Q8R3L8 464 aa10.61□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Snw1Q9CSN1 536 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dpp7Q9ET22 506 aa10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.7 ms