RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P SIP4P46954 829 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)PtW(CCA)P ATG36P46983 293 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)PtW(CCA)P YJL132WP47014 750 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)PtW(CCA)P TCB2P48231 1178 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)PtW(CCA)P RFX1P48743 811 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)PtW(CCA)P SPC105P53148 917 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)PtW(CCA)P YGR021WP53212 290 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)PtW(CCA)P YNL108CP53929 270 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)PtW(CCA)P CDC14Q00684 551 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)PtW(CCA)P YPL113CQ02961 396 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)PtW(CCA)P NGL3Q03210 505 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)PtW(CCA)P ENT5Q03769 411 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)PtW(CCA)P UTP5Q04177 643 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)PtW(CCA)P EMI1Q04406 187 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)PtW(CCA)P POB3Q04636 552 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)PtW(CCA)P ARG7Q04728 441 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)PtW(CCA)P SOV1Q04748 898 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)PtW(CCA)P YDL073WQ07454 984 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)PtW(CCA)P YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data2.66□□□□□ -1.98not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P LDB18Q07887 179 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)PtW(CCA)P CMS1Q07897 291 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)PtW(CCA)P TRM8Q12009 286 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)PtW(CCA)P GPM3Q12326 303 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)PtW(CCA)P OCA6Q12454 224 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)PtW(CCA)P AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)PtW(CCA)P ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)PtW(CCA)P YLR462WO13556 202 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P YPR089WO13585 888 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P RAD10P06838 210 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P TUB1P09733 447 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P PPH21P23594 369 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SNT1P25357 1226 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SFP1P32432 683 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P IME2P32581 645 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data2.65□□□□□ -1.99not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P MFT1P33441 392 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SLD2P34252 453 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P MIC60P36112 540 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P MUM2P38236 366 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P UBP14P38237 781 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P DIA4P38705 446 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P YHL049CP38722 271 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P YHL041WP38730 149 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P UME6P39001 836 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SAW1P39735 261 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P RGI2P40188 164 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P ELO3P40319 345 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P IRR1P40541 1150 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P YFL064CP43540 174 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P RGD2P43556 714 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P FET5P43561 622 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P ALK1P43633 760 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P YML6P51998 286 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SAP4P53036 818 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SWC4P53201 476 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P HST3P53687 447 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P FRE4P53746 719 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P YNL247WP53852 767 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P EAF7P53911 425 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P VPS9P54787 451 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P RSC4Q02206 625 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SYH1Q02875 849 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P ATG16Q03818 150 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P ARX1Q03862 593 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P GSF2Q04697 403 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P ENT2Q05785 613 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P GRX8Q05926 109 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P THI7Q05998 598 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P KAP95Q06142 861 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data2.65□□□□□ -1.99not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P ALR1Q08269 859 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P AAD15Q08361 143 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P CIR2Q08822 631 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SUL2Q12325 893 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P YBL111CQ3E7Y5 667 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P GAL4P04386 881 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P TUB3P09734 445 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SBP1P10080 294 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P PMS1P14242 873 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P STE4P18851 423 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data2.64□□□□□ -1.99not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P RDS2P19541 446 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P GAL11P19659 1081 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P HOP1P20050 605 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P EPT1P22140 391 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P UBA1P22515 1024 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P VAN1P23642 535 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P MRPL9P31334 269 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P KNS1P32350 737 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P AEP1P32493 518 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P PET309P32522 965 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SPR1P32603 445 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P TFC3P34111 1160 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P PHO11P35842 467 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P KES1P35844 434 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P YKL151CP36059 337 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data2.64□□□□□ -1.99not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P FUI1P38196 639 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P PHO12P38693 467 aa2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.9 ms