RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M SIP4P46954 829 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M ATG36P46983 293 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M YJL132WP47014 750 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M TCB2P48231 1178 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M RFX1P48743 811 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M SPC105P53148 917 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M YGR021WP53212 290 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M YNL108CP53929 270 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M CDC14Q00684 551 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M YPL113CQ02961 396 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M NGL3Q03210 505 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M ENT5Q03769 411 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M UTP5Q04177 643 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M EMI1Q04406 187 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M POB3Q04636 552 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M ARG7Q04728 441 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M SOV1Q04748 898 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M YDL073WQ07454 984 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data2.66□□□□□ -1.98not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M LDB18Q07887 179 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M CMS1Q07897 291 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M TRM8Q12009 286 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M GPM3Q12326 303 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M OCA6Q12454 224 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M YLR462WO13556 202 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M YPR089WO13585 888 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M RAD10P06838 210 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M TUB1P09733 447 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M PPH21P23594 369 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M SNT1P25357 1226 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M SFP1P32432 683 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M IME2P32581 645 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data2.65□□□□□ -1.99not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M MFT1P33441 392 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M SLD2P34252 453 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M MIC60P36112 540 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M MUM2P38236 366 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M UBP14P38237 781 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M DIA4P38705 446 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M YHL049CP38722 271 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M YHL041WP38730 149 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M UME6P39001 836 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M SAW1P39735 261 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M RGI2P40188 164 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M ELO3P40319 345 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M IRR1P40541 1150 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M YFL064CP43540 174 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M RGD2P43556 714 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M FET5P43561 622 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M ALK1P43633 760 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M YML6P51998 286 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M SAP4P53036 818 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M SWC4P53201 476 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M HST3P53687 447 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M FRE4P53746 719 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M YNL247WP53852 767 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M EAF7P53911 425 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M VPS9P54787 451 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M RSC4Q02206 625 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M SYH1Q02875 849 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M ATG16Q03818 150 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M ARX1Q03862 593 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M GSF2Q04697 403 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M ENT2Q05785 613 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M GRX8Q05926 109 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M THI7Q05998 598 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M KAP95Q06142 861 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data2.65□□□□□ -1.99not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M ALR1Q08269 859 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M AAD15Q08361 143 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M CIR2Q08822 631 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M SUL2Q12325 893 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M YBL111CQ3E7Y5 667 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M GAL4P04386 881 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M TUB3P09734 445 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M SBP1P10080 294 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M PMS1P14242 873 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M STE4P18851 423 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data2.64□□□□□ -1.99not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M RDS2P19541 446 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M GAL11P19659 1081 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M HOP1P20050 605 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M EPT1P22140 391 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M UBA1P22515 1024 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M VAN1P23642 535 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M MRPL9P31334 269 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M KNS1P32350 737 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M AEP1P32493 518 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M PET309P32522 965 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M SPR1P32603 445 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M TFC3P34111 1160 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M PHO11P35842 467 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M KES1P35844 434 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M YKL151CP36059 337 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data2.64□□□□□ -1.99not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M FUI1P38196 639 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M PHO12P38693 467 aa2.64□□□□□ -1.99
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