RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J SIP4P46954 829 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)JtW(CCA)J ATG36P46983 293 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)JtW(CCA)J YJL132WP47014 750 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)JtW(CCA)J TCB2P48231 1178 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)JtW(CCA)J RFX1P48743 811 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)JtW(CCA)J SPC105P53148 917 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR021WP53212 290 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL108CP53929 270 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC14Q00684 551 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL113CQ02961 396 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)JtW(CCA)J NGL3Q03210 505 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)JtW(CCA)J ENT5Q03769 411 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)JtW(CCA)J UTP5Q04177 643 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)JtW(CCA)J EMI1Q04406 187 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)JtW(CCA)J POB3Q04636 552 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)JtW(CCA)J ARG7Q04728 441 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)JtW(CCA)J SOV1Q04748 898 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)JtW(CCA)J YDL073WQ07454 984 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)JtW(CCA)J YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data2.66□□□□□ -1.98not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J LDB18Q07887 179 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)JtW(CCA)J CMS1Q07897 291 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)JtW(CCA)J TRM8Q12009 286 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)JtW(CCA)J GPM3Q12326 303 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)JtW(CCA)J OCA6Q12454 224 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)JtW(CCA)J AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)JtW(CCA)J ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR462WO13556 202 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR089WO13585 888 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J RAD10P06838 210 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J TUB1P09733 447 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J PPH21P23594 369 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J SNT1P25357 1226 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J SFP1P32432 683 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J IME2P32581 645 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data2.65□□□□□ -1.99not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J MFT1P33441 392 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J SLD2P34252 453 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J MIC60P36112 540 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J MUM2P38236 366 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J UBP14P38237 781 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J DIA4P38705 446 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J YHL049CP38722 271 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J YHL041WP38730 149 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J UME6P39001 836 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J SAW1P39735 261 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J RGI2P40188 164 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J ELO3P40319 345 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J IRR1P40541 1150 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J YFL064CP43540 174 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J RGD2P43556 714 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J FET5P43561 622 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J ALK1P43633 760 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J YML6P51998 286 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J SAP4P53036 818 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J SWC4P53201 476 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J HST3P53687 447 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J FRE4P53746 719 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL247WP53852 767 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J EAF7P53911 425 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS9P54787 451 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J RSC4Q02206 625 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J SYH1Q02875 849 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J ATG16Q03818 150 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J ARX1Q03862 593 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J GSF2Q04697 403 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J ENT2Q05785 613 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J GRX8Q05926 109 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J THI7Q05998 598 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J KAP95Q06142 861 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data2.65□□□□□ -1.99not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J ALR1Q08269 859 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J AAD15Q08361 143 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J CIR2Q08822 631 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J SUL2Q12325 893 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J YBL111CQ3E7Y5 667 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J GAL4P04386 881 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J TUB3P09734 445 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J SBP1P10080 294 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J PMS1P14242 873 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J STE4P18851 423 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data2.64□□□□□ -1.99not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J RDS2P19541 446 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J GAL11P19659 1081 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J HOP1P20050 605 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J EPT1P22140 391 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J UBA1P22515 1024 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J VAN1P23642 535 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPL9P31334 269 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J KNS1P32350 737 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J AEP1P32493 518 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J PET309P32522 965 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J SPR1P32603 445 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J TFC3P34111 1160 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J PHO11P35842 467 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J KES1P35844 434 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J YKL151CP36059 337 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data2.64□□□□□ -1.99not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J FUI1P38196 639 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J PHO12P38693 467 aa2.64□□□□□ -1.99
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