RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	ARL4D	P49703	201 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	CEP89	Q96ST8	783 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	ARAP1	Q96P48	1450 aa		6.52	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	UACA	Q9BZF9	1416 aa		6.52	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	C4orf46	Q504U0	113 aa		6.52	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		6.52	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		6.52	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		6.52	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	SHD	Q96IW2	340 aa		6.52	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		6.52	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		6.51	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	DLL1	O00548	723 aa		6.51	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	ELN	P15502	786 aa		6.51	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	PAX3	P23760	479 aa		6.51	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	6.51	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	UBE4A	Q14139	1066 aa		6.51	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	6.51	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		6.51	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	6.51	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		6.51	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		6.51	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		6.51	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM74	Q96NL1	305 aa		6.51	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		6.51	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		6.51	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	6.51	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		6.51	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	PDPK1	O15530	556 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	FBXO24	O75426	580 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	GSTM4	Q03013	218 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	PWP1	Q13610	501 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	DDR2	Q16832	855 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	RELL1	Q8IUW5	271 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	RELT	Q969Z4	430 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	CEP44	Q9C0F1	390 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCA8	O94911	1581 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNQ2	O43526	872 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	GART	P22102	1010 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	GNAL	P38405	381 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	RASGRF1	Q13972	1273 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	GRIK4	Q16099	956 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	C2orf27A	Q580R0	203 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC39A13	Q96H72	371 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	RHOV	Q96L33	236 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	ST7	Q9NRC1	585 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	UBP1	Q9NZI7	540 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		6.5	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCC2	Q92887	1545 aa		6.49	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		6.49	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		6.49	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		6.49	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	ENC1	O14682	589 aa		6.49	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	ADAM11	O75078	769 aa		6.49	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	TNNI3K	Q59H18	835 aa		6.49	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		6.49	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		6.49	□□□□□ -1.37
EFHC1-223	ENST00000636616	SV2B	Q7L1I2	683 aa		6.49	□□□□□ -1.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms