RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635466.1

NRXN3-218, Transcript of neurexin 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene NRXN3, Length 5,254 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3-218ENST00000635466 CLRN2A0PK11 232 aa13.16□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa13.16□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 VWA3AA6NCI4 1184 aa13.15□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 SASH1O94885 1247 aa13.15□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 CFBP00751 764 aa13.15□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 KRT40Q6A162 431 aa13.15□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 ISM2Q6H9L7 571 aa13.15□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 ARMC9Q7Z3E5 817 aa13.15□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 MAP4K1Q92918 833 aa13.15□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 KCNG1Q9UIX4 513 aa13.15□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 IQGAP1P46940 1657 aa13.15□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 PPLO60437 1756 aa13.15□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 NOP56O00567 594 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 PHACTR2O75167 634 aa13.15□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 SP4Q02446 784 aa13.15□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 USH1GQ495M9 461 aa13.15□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 SLFN13Q68D06 897 aa13.15□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 MCF2L2Q86YR7 1114 aa13.15□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 FANCBQ8NB91 859 aa13.15□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 ELP1O95163 1332 aa13.15□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 GALNT17Q6IS24 598 aa13.15□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 NLRX1Q86UT6 975 aa13.15□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 SP8Q8IXZ3 490 aa13.15□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 FERMT2Q96AC1 680 aa13.15□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 RASGRF1Q13972 1273 aa13.15□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 IMPG2Q9BZV3 1241 aa13.15□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa13.15□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 SERPINB13Q9UIV8 391 aa13.15□□□□□ -0.3
NRXN3-218ENST00000635466 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa13.15□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 USP8P40818 1118 aa13.14□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 GIMAP6Q6P9H5 292 aa13.14□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 DRC1Q96MC2 740 aa13.14□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 KANSL2Q9H9L4 492 aa13.14□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 PI4KBQ9UBF8 816 aa13.14□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 USP17L8P0C7I0 530 aa13.14□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 GADL1Q6ZQY3 521 aa13.14□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 TBC1D5Q92609 795 aa13.14□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 PHKBQ93100 1093 aa13.14□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 GTF3C6Q969F1 213 aa13.14□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP13.14□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 PKD2L1Q9P0L9 805 aa13.14□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 KLRF2D3W0D1 207 aa13.13□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 CUTAO60888 179 aa13.13□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 EPHA10Q5JZY3 1008 aa13.13□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 PLA2G12BQ9BX93 195 aa13.13□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 AZI2Q9H6S1 392 aa13.13□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 ZMYM6O95789 1325 aa13.13□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 SMCO2A6NFE2 343 aa13.13□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 RPL13P26373 211 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 SMTNP53814 917 aa13.13□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 GNPTABQ3T906 1256 aa13.13□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 CCDC112Q8NEF3 446 aa13.13□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 SLC16A10Q8TF71 515 aa13.13□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 CRAMP1Q96RY5 1269 aa13.13□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 HOMER2Q9NSB8 354 aa13.13□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 LRSAM1Q6UWE0 723 aa13.13□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 ADCY9O60503 1353 aa13.13□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 KIF1AQ12756 1690 aa13.13□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 SPDYE4A6NLX3 237 aa13.13□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 PFKFB2O60825 505 aa13.13□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 MECOMQ03112 1051 aa13.13□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 TEX35Q5T0J7 233 aa13.13□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 FBXO11Q86XK2 927 aa13.13□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 CPLX3Q8WVH0 158 aa13.13□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 ANTXR1Q9H6X2 564 aa13.13□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 NOD1Q9Y239 953 aa13.13□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 KIF5CO60282 957 aa13.12□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa13.12□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 ASPRV1Q53RT3 343 aa13.12□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 TTLL1O95922 423 aa13.12□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 SPAG5Q96R06 1193 aa13.12□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 TXKP42681 527 aa13.12□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 TMC6Q7Z403 805 aa13.12□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 SYNE4Q8N205 404 aa13.12□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 FAM200AQ8TCP9 573 aa13.12□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 PAGR1Q9BTK6 254 aa13.12□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 CD209Q9NNX6 404 aa13.12□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 LRWD1Q9UFC0 647 aa13.12□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 USP25Q9UHP3 1055 aa13.12□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 FLOT1O75955 427 aa13.12□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 POLR2MP0CAP2 368 aa13.12□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 IREB2P48200 963 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 CCNA1P78396 465 aa13.12□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 FAM160A1Q05DH4 1040 aa13.12□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 FMNL3Q8IVF7 1028 aa13.12□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 IFT74Q96LB3 600 aa13.12□□□□□ -0.31
NRXN3-218ENST00000635466 ANKRD62A6NC57 917 aa13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms