RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 RNF20Q5VTR2 975 aa25.4■■□□□ 1.66
SGMS1-210ENST00000619438 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa25.4■■□□□ 1.66
SGMS1-210ENST00000619438 SAGE1Q9NXZ1 904 aa25.4■■□□□ 1.66
SGMS1-210ENST00000619438 PI4KBQ9UBF8 816 aa25.4■■□□□ 1.66
SGMS1-210ENST00000619438 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa25.4■■□□□ 1.66
SGMS1-210ENST00000619438 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.4■■□□□ 1.66
SGMS1-210ENST00000619438 FLT1P17948 1338 aa25.39■■□□□ 1.66
SGMS1-210ENST00000619438 GJA5P36382 358 aa25.39■■□□□ 1.66
SGMS1-210ENST00000619438 RUFY3Q7L099 469 aa25.39■■□□□ 1.66
SGMS1-210ENST00000619438 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
SGMS1-210ENST00000619438 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
SGMS1-210ENST00000619438 PSMA5P28066 241 aa25.39■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.39■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 ATRNL1Q5VV63 1379 aa25.38■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 MAST2Q6P0Q8 1798 aa25.38■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.38■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 SLC27A2O14975 620 aa25.38■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 SLURP2P0DP57 97 aa25.38■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 ADD2P35612 726 aa25.38■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 MAP3K10Q02779 954 aa25.38■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 MCTP1Q6DN14 999 aa25.38■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM34Q9BYJ4 488 aa25.38■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 LMBRD1Q9NUN5 540 aa25.38■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 TBC1D12O60347 775 aa25.37■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 IFFO2Q5TF58 517 aa25.37■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.37■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 PICK1Q9NRD5 415 aa25.37■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 PDRG1Q9NUG6 133 aa25.37■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa25.36■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 PHF20L1A8MW92 1017 aa25.36■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 GTF2A2P52657 109 aa25.36■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 ADCK5Q3MIX3 580 aa25.36■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 FAM196BA6NMK8 535 aa25.36■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 ALDH1A1P00352 501 aa25.36■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 HLA-DOAP06340 250 aa25.36■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 PPATQ06203 517 aa25.36■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.36■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 LAMB1P07942 1786 aa25.35■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 TBC1D8O95759 1140 aa25.35■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 UBE3CQ15386 1083 aa25.35■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa25.35■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 IFNL1Q8IU54 200 aa25.35■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 IRF6O14896 467 aa25.34■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa25.34■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.34■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 DOCK2Q92608 1830 aa25.34■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa25.33■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 MRE11P49959 708 aa25.33■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 PPIL2Q13356 520 aa25.33■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 CCL15Q16663 113 aa25.33■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.33■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 ARMT1Q9H993 441 aa25.33■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
SGMS1-210ENST00000619438 SNAPC2Q13487 334 aa25.32■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 KRT32Q14532 448 aa25.32■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 LCORLQ8N3X6 602 aa25.32■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 HELLSQ9NRZ9 838 aa25.32■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 MBD4O95243 580 aa25.32■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 CHGBP05060 677 aa25.32■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 CETPP11597 493 aa25.32■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 TTC6Q86TZ1 520 aa25.32■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.32■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 ANKRD1Q15327 319 aa25.31■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 SDR42E1Q8WUS8 393 aa25.3■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 PTPN18Q99952 460 aa25.3■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 MCM9Q9NXL9 1143 aa25.3■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa25.3■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 CPA1P15085 419 aa25.29■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 PTPRAP18433 802 aa25.29■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 BRI3BPQ8WY22 251 aa25.29■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.648e-7■■■■■ 41.4
SGMS1-210ENST00000619438 RPS6KB1P23443 525 aa25.29■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa25.29■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 CAP2P40123 477 aa25.28■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.28■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.27■■□□□ 1.64
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