RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619348.4

CYFIP1-211, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CYFIP1, Length 3,471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-211ENST00000619348 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CYFIP1-211ENST00000619348 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CYFIP1-211ENST00000619348 ZPR1O75312 459 aa14.97□□□□□ -0.01
CYFIP1-211ENST00000619348 GUCY1A2P33402 732 aa14.97□□□□□ -0.01
CYFIP1-211ENST00000619348 ANTXR2P58335 489 aa14.97□□□□□ -0.01
CYFIP1-211ENST00000619348 WASF1Q92558 559 aa14.97□□□□□ -0.01
CYFIP1-211ENST00000619348 VPS54Q9P1Q0 977 aa14.97□□□□□ -0.01
CYFIP1-211ENST00000619348 CEP131Q9UPN4 1083 aa14.97□□□□□ -0.01
CYFIP1-211ENST00000619348 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.01
CYFIP1-211ENST00000619348 MIGA1Q8NAN2 632 aa14.97□□□□□ -0.01
CYFIP1-211ENST00000619348 KIFC2Q96AC6 838 aa14.97□□□□□ -0.01
CYFIP1-211ENST00000619348 SIRT1Q96EB6 747 aa14.97□□□□□ -0.01
CYFIP1-211ENST00000619348 GOLGA6BA6NDN3 693 aa14.96□□□□□ -0.01
CYFIP1-211ENST00000619348 PPP6R2O75170 966 aa14.96□□□□□ -0.01
CYFIP1-211ENST00000619348 IDEP14735 1019 aa14.96□□□□□ -0.01
CYFIP1-211ENST00000619348 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CYFIP1-211ENST00000619348 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CYFIP1-211ENST00000619348 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CYFIP1-211ENST00000619348 ABCF2Q9UG63 623 aa14.96□□□□□ -0.01
CYFIP1-211ENST00000619348 L1RE1Q9UN81 338 aa14.96□□□□□ -0.01
CYFIP1-211ENST00000619348 PXDNLA1KZ92 1463 aa14.96□□□□□ -0.01
CYFIP1-211ENST00000619348 PLCD1P51178 756 aa14.96□□□□□ -0.01
CYFIP1-211ENST00000619348 WTAPQ15007 396 aa14.96□□□□□ -0.01
CYFIP1-211ENST00000619348 CCDC96Q2M329 555 aa14.96□□□□□ -0.01
CYFIP1-211ENST00000619348 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.96□□□□□ -0.01
CYFIP1-211ENST00000619348 CTAGE1Q96RT6 745 aa14.96□□□□□ -0.01
CYFIP1-211ENST00000619348 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa14.96□□□□□ -0.01
CYFIP1-211ENST00000619348 TMEM2Q9UHN6 1383 aa14.96□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 ZMYM6O95789 1325 aa14.96□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 NDUFAB1O14561 156 aa14.96□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 SLC20A2Q08357 652 aa14.96□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 KANK3Q6NY19 840 aa14.96□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 TBC1D10CQ8IV04 446 aa14.96□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 CABLES1Q8TDN4 633 aa14.96□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 GNGT1P63211 74 aa14.95□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 LRRC31Q6UY01 552 aa14.95□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 CHP1Q99653 195 aa14.95□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 KCND1Q9NSA2 647 aa14.95□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 SAR1BQ9Y6B6 198 aa14.95□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 KAT6BQ8WYB5 2073 aa14.95□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 GGCXP38435 758 aa14.95□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 PDIA6Q15084 440 aa14.95□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 FBXW10Q5XX13 1052 aa14.95□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 CYP26C1Q6V0L0 522 aa14.95□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 TMTC1Q8IUR5 882 aa14.95□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 OXER1Q8TDS5 423 aa14.95□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 TRIM47Q96LD4 638 aa14.95□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 ORAI2Q96SN7 254 aa14.95□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 MFAP3LO75121 409 aa14.94□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 INPP5BP32019 993 aa14.94□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 CYP27A1Q02318 531 aa14.94□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 SPATA1Q5VX52 437 aa14.94□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 TMEM139Q8IV31 216 aa14.94□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 IFT81Q8WYA0 676 aa14.94□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 EHD4Q9H223 541 aa14.94□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.94□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 FAM205CA6NFA0 338 aa14.94□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 CXCR5P32302 372 aa14.94□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 MCM7P33993 719 aa14.94□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 SLC7A5Q01650 507 aa14.94□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa14.94□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 RILPL1Q5EBL4 403 aa14.94□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 SLC52A2Q9HAB3 445 aa14.94□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 OTUD6BQ8N6M0 293 aa14.94□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa14.94□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 ARMT1Q9H993 441 aa14.94□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 CAPN7Q9Y6W3 813 aa14.94□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.93□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 PPFIA4O75335 1185 aa14.93□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 C2orf54Q08AI8 447 aa14.93□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 MED4Q9NPJ6 270 aa14.93□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 ZNF532Q9HCE3 1301 aa14.93□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 MBD4O95243 580 aa14.93□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 SPA17Q15506 151 aa14.93□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 ZNF185O15231 689 aa14.93□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 ATG9AQ7Z3C6 839 aa14.93□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.93□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 CEP57Q86XR8 500 aa14.93□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.93□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 JAKMIP2Q96AA8 810 aa14.93□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 LRP2BPQ9P2M1 347 aa14.93□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 AXIN2Q9Y2T1 843 aa14.93□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 SNAP23O00161 211 aa14.92□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 PTPAQ15257 358 aa14.92□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 IFNL2Q8IZJ0 200 aa14.92□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 MAGEB6Q8N7X4 407 aa14.92□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.92□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 PANX2Q96RD6 677 aa14.92□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa14.92□□□□□ -0.02
CYFIP1-211ENST00000619348 ODF2Q5BJF6 829 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms