RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	ST3GAL1	Q11201	340 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	WTAP	Q15007	396 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF174	Q15697	407 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	11.33	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	CLIC4	Q9Y696	253 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP2B4	P23634	1241 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	SPEF2	Q9C093	1822 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM205C	A6NFA0	338 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	GRIK5	Q16478	980 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	PDE6B	P35913	854 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	DMTN	Q08495	405 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	VEZT	Q9HBM0	779 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	SORBS3	O60504	671 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	ZBTB7A	O95365	584 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	PPARA	Q07869	468 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	AKT1S1	Q96B36	256 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	CD209	Q9NNX6	404 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	TMEM51	Q9NW97	253 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	RREB1	Q92766	1687 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	COL4A1	P02462	1669 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	NEDD4	P46934	1319 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232		H0YIN7	160 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	PFKFB2	O60825	505 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	KRT23	Q9C075	422 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	SBF2	Q86WG5	1849 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	ALDH1B1	P30837	517 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	BAG6	P46379	1132 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF165	P49910	485 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	LRMP	Q12912	555 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	MAP3K11	Q16584	847 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	CLRN2	A0PK11	232 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	CDC27	P30260	824 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	MCM7	P33993	719 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	CHMP4BP1	P59074	171 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	BAG3	O95817	575 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	MBD3	O95983	291 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	NPR1	P16066	1061 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	ANTXR2	P58335	489 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	CRY2	Q49AN0	593 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	POLL	Q9UGP5	575 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	ARID5B	Q14865	1188 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC15A2	Q16348	729 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6

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