RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CYP2D6P10635 497 aa13.57□□□□□ -0.24
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 USP17L8P0C7I0 530 aa13.52□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GSDMDP57764 484 aa13.52□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PTPN14Q15678 1187 aa13.52□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF174Q15697 407 aa13.52□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OLFM4Q6UX06 510 aa13.52□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAN1B1Q9UKM7 699 aa13.52□□□□□ -0.24
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP13.52□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PHF20Q9BVI0 1012 aa13.52□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NYXQ9GZU5 481 aa13.52□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MCM9Q9NXL9 1143 aa13.52□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MYH6P13533 1939 aa13.51□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LAMB2P55268 1798 aa13.51□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RCAN1P53805 252 aa13.51□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GRIK5Q16478 980 aa13.51□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DHX58Q96C10 678 aa13.51□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa13.51□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MTMR7Q9Y216 660 aa13.51□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRIM75PA6NK02 468 aa13.51□□□□□ -0.25
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