RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599531.1

PNMA8B-202, Transcript of PNMA family member 8B, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene PNMA8B, Length 5,308 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8B-202ENST00000599531 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa21.41■■□□□ 1.02
PNMA8B-202ENST00000599531 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
PNMA8B-202ENST00000599531 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
PNMA8B-202ENST00000599531 ZEB2O60315 1214 aa21.4■■□□□ 1.02
PNMA8B-202ENST00000599531 C8orf74Q6P047 294 aa21.4■■□□□ 1.02
PNMA8B-202ENST00000599531 ZNF354CQ86Y25 554 aa21.4■■□□□ 1.02
PNMA8B-202ENST00000599531 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PNMA8B-202ENST00000599531 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.4■■□□□ 1.02
PNMA8B-202ENST00000599531 KRT9P35527 623 aa21.4■■□□□ 1.02
PNMA8B-202ENST00000599531 MXRA7P84157 204 aa21.4■■□□□ 1.02
PNMA8B-202ENST00000599531 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PNMA8B-202ENST00000599531 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.4■■□□□ 1.02
PNMA8B-202ENST00000599531 SMIM23A6NLE4 172 aa21.4■■□□□ 1.02
PNMA8B-202ENST00000599531 SPOPO43791 374 aa21.4■■□□□ 1.02
PNMA8B-202ENST00000599531 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PNMA8B-202ENST00000599531 DNM3Q9UQ16 869 aa21.4■■□□□ 1.02
PNMA8B-202ENST00000599531 ERVK-7P63135 1459 aa21.4■■□□□ 1.02
PNMA8B-202ENST00000599531 CCDC169A6NNP5 214 aa21.4■■□□□ 1.02
PNMA8B-202ENST00000599531 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa21.4■■□□□ 1.02
PNMA8B-202ENST00000599531 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PNMA8B-202ENST00000599531 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PNMA8B-202ENST00000599531 PALD1Q9ULE6 856 aa21.4■■□□□ 1.02
PNMA8B-202ENST00000599531 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.39■■□□□ 1.02
PNMA8B-202ENST00000599531 LTKP29376 864 aa21.39■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 CSRNP2Q9H175 543 aa21.39■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 RGS12O14924 1447 aa21.39■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 IFT74Q96LB3 600 aa21.39■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 MBD5Q9P267 1494 aa21.39■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.39■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 CARD6Q9BX69 1037 aa21.39■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 PICK1Q9NRD5 415 aa21.39■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 STAP2Q9UGK3 403 aa21.39■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 DTNBO60941 627 aa21.38■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 OTUD6BQ8N6M0 293 aa21.38■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 CCDC63Q8NA47 563 aa21.38■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.38■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 ZBTB16Q05516 673 aa21.38■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 CCDC6Q16204 474 aa21.38■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.38■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 GPATCH11Q8N954 259 aa21.38■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 SLAIN2Q9P270 581 aa21.38■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 SERTAD1Q9UHV2 236 aa21.38■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 MTMR6Q9Y217 621 aa21.38■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 IQCDQ96DY2 449 aa21.38■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 STX10O60499 249 aa21.38■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 KDM5CP41229 1560 aa21.38■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 MYRIPQ8NFW9 859 aa21.37■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 KIAA1468Q9P260 1216 aa21.37■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 ZMYM6O95789 1325 aa21.37■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.37■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 PFKFB1P16118 471 aa21.37■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 TERF1P54274 439 aa21.37■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 PNOCQ13519 176 aa21.37■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 FAM47AQ5JRC9 791 aa21.37■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 DYMQ7RTS9 669 aa21.37■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.37■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.37■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 TMOD4Q9NZQ9 345 aa21.37■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 ATP7BP35670 1465 aa21.37■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 MTX1Q13505 466 aa21.37■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 CEP128Q6ZU80 1094 aa21.37■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 SAMD15Q9P1V8 674 aa21.37■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 PDE6AP16499 860 aa21.36■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 KCNK9Q9NPC2 374 aa21.36■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.36■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.36■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 MAGEA1P43355 309 aa21.36■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 UBL4BQ8N7F7 174 aa21.36■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.36■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 KIAA1524Q8TCG1 905 aa21.36■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 SMC6Q96SB8 1091 aa21.36■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 COPRSQ9NQ92 184 aa21.36■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 STK32BQ9NY57 414 aa21.36■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 TXNDC16Q9P2K2 825 aa21.36■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 STRN3Q13033 797 aa21.36■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 LIN9Q5TKA1 542 aa21.36■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.36■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 ATP5DP30049 168 aa21.35■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 USP28Q96RU2 1077 aa21.35■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 NT5C3AQ9H0P0 336 aa21.35■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 USP17L12C9JPN9 530 aa21.35■■□□□ 1.01
PNMA8B-202ENST00000599531 USP17L21D6R901 530 aa21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms