RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598904.5

RINL-208, Transcript of Ras and Rab interactor like, human

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene RINL, Length 1,846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RINL-208	ENST00000598904	GRIN3B	O60391	1043 aa		28.66	■■■□□ 2.18
RINL-208	ENST00000598904	SEC23A	Q15436	765 aa		28.66	■■■□□ 2.18
RINL-208	ENST00000598904	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		28.66	■■■□□ 2.18
RINL-208	ENST00000598904	NUCB2	P80303	420 aa		28.65	■■■□□ 2.18
RINL-208	ENST00000598904	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
RINL-208	ENST00000598904	APOA5	Q6Q788	366 aa		28.65	■■■□□ 2.18
RINL-208	ENST00000598904	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
RINL-208	ENST00000598904	FAM151A	Q8WW52	585 aa		28.65	■■■□□ 2.18
RINL-208	ENST00000598904	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		28.65	■■■□□ 2.18
RINL-208	ENST00000598904	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		28.64	■■■□□ 2.18
RINL-208	ENST00000598904	ZBTB43	O43298	467 aa		28.64	■■■□□ 2.18
RINL-208	ENST00000598904	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.18
RINL-208	ENST00000598904	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.18
RINL-208	ENST00000598904	VEZT	Q9HBM0	779 aa		28.64	■■■□□ 2.18
RINL-208	ENST00000598904	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.18
RINL-208	ENST00000598904	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.18
RINL-208	ENST00000598904	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	RCAN1	P53805	252 aa		28.64	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		28.64	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	FAM83A	Q86UY5	434 aa		28.64	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	SENP2	Q9HC62	589 aa		28.64	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	SHTN1	A0MZ66	631 aa		28.63	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		28.63	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	DGKH	Q86XP1	1220 aa		28.63	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		28.63	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		28.63	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	28.62	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		28.62	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		28.62	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	SBF1	O95248	1867 aa		28.62	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	TNNI2	P48788	182 aa		28.62	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		28.62	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	GJB2	P29033	226 aa		28.61	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		28.61	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	CPLX1	O14810	134 aa		28.6	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	TNFAIP1	Q13829	316 aa		28.6	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		28.6	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		28.6	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		28.6	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	ANKS1A	Q92625	1134 aa		28.6	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	CSRNP1	Q96S65	589 aa		28.6	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	PPP2R5B	Q15173	497 aa		28.59	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	MICU3	Q86XE3	530 aa		28.59	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		28.59	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	CCDC17	Q96LX7	622 aa		28.59	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	NMT2	O60551	498 aa		28.59	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		28.59	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		28.58	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	CALM1	P0DP23	149 aa		28.58	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	CALM2	P0DP24	149 aa		28.58	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	CALM3	P0DP25	149 aa		28.58	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	SHMT1	P34896	483 aa		28.58	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		28.58	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	KIF3A	Q9Y496	699 aa		28.58	■■■□□ 2.17
RINL-208	ENST00000598904	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		28.57	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	PDC	P20941	246 aa		28.57	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		28.57	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	CNTNAP1	P78357	1384 aa		28.57	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	EGFR	P00533	1210 aa		28.57	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		28.57	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	KAT14	Q9H8E8	782 aa		28.57	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	CDKL5	O76039	1030 aa		28.56	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	DDAH1	O94760	285 aa		28.56	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		28.56	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		28.56	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	UTRN	P46939	3433 aa		28.56	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	NID2	Q14112	1375 aa		28.56	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	CTDNEP1	O95476	244 aa		28.55	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		28.55	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	MYL10	Q9BUA6	226 aa		28.55	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		28.55	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	RXRA	P19793	462 aa		28.55	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	RTN1	Q16799	776 aa		28.55	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		28.55	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		28.55	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	FANCB	Q8NB91	859 aa		28.55	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		28.55	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	STX8	Q9UNK0	236 aa		28.55	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	28.54	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		28.54	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	JAK2	O60674	1132 aa		28.54	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	28.54	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	DNAJC18	Q9H819	358 aa		28.54	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	AKR1B1	P15121	316 aa		28.53	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		28.53	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	SYT1	P21579	422 aa		28.53	■■■□□ 2.16
RINL-208	ENST00000598904	TROAP	Q12815	778 aa		28.53	■■■□□ 2.16

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