RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592582.5

SEH1L-210, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 4,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-210ENST00000592582 ADCK5Q3MIX3 580 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 OLFM4Q6UX06 510 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 PDILTQ8N807 584 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 SLAIN1Q8ND83 568 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 KAZALD1Q96I82 304 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 FUCA2Q9BTY2 467 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 PLSCR2Q9NRY7 297 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 TPCN1Q9ULQ1 816 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 COL24A1Q17RW2 1714 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 MED23Q9ULK4 1368 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 KIF5CO60282 957 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 TOP1P11387 765 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 KCNJ6P48051 423 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 EPHA10Q5JZY3 1008 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
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SEH1L-210ENST00000592582 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 MYO6Q9UM54 1294 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 AKAP11Q9UKA4 1901 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 A0A0G2JS52 829 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 TRIM29Q14134 588 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 BRF1Q92994 677 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 RAI14Q9P0K7 980 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 UBAP1LF5GYI3 381 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 C6orf229H3BNL8 230 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 NEBLO76041 1014 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 A1BGP04217 495 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 TXLNAP40222 546 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 BRINP3Q76B58 766 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC50Q8IVM0 306 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 OTUD6BQ8N6M0 293 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 TMCO5BA8MYB1 307 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 EXOC5O00471 708 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 CFAP100Q494V2 611 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
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SEH1L-210ENST00000592582 CENPHQ9H3R5 247 aa6.77□□□□□ -1.33
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SEH1L-210ENST00000592582 ABCC12Q96J65 1359 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF213O14771 459 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 TOM1O60784 492 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 PFKFB2O60825 505 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 AP1ARQ63HQ0 302 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 JMYQ8N9B5 988 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 NCOA7Q8NI08 942 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 CABS1Q96KC9 395 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 IL25Q9H293 177 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 MEGF6O75095 1541 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 MAST2Q6P0Q8 1798 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 TIE1P35590 1138 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 ARHGAP25P42331 645 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 ME1P48163 572 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 NACAP1Q9BZK3 213 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 OCEL1Q9H607 264 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 PDE11AQ9HCR9 933 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 TNS2Q63HR2 1409 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 PALLDQ8WX93 1383 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 USP27XA6NNY8 438 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.338e-10■■■□□ 16.2
SEH1L-210ENST00000592582 CHMP4BP1P59074 171 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 PIP4K2BP78356 416 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 APOBRQ0VD83 1088 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 PACS2Q86VP3 889 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
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