RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592326.1

USP36-223, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, human

TSL 5

Gene USP36, Length 406 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP36-223	ENST00000592326	STAP2	Q9UGK3	403 aa		13.8	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	FLT1	P17948	1338 aa		13.8	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	RPTOR	Q8N122	1335 aa		13.8	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	PEX10	O60683	326 aa		13.79	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	TRIM32	Q13049	653 aa		13.79	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	POLA2	Q14181	598 aa		13.79	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		13.79	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		13.79	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		13.79	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	GJD2	Q9UKL4	321 aa		13.79	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	MGAM	O43451	1857 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	HERVK_113	P62684	666 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	JAG1	P78504	1218 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	SSH3	Q8TE77	659 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	FEZ1	Q99689	392 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	NBPF3	Q9H094	633 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	GINM1	Q9NU53	330 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP36-223	ENST00000592326	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	MAPK4	P31152	587 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	TRIB2	Q92519	343 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	DNAJC18	Q9H819	358 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326		A0A1W2PPC1	479 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	IGSF3	O75054	1194 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	GH2	P01242	217 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	RGS2	P41220	211 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	WDR78	Q5VTH9	848 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	PRO3102	Q9H379	93 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	SYN1	P17600	705 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	ERVK-9	P63128	1117 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	ERVK-24	P63145	666 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	MAP3K12	Q12852	859 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326		Q3C1V9	767 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	TTC6	Q86TZ1	520 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	CERS3	Q8IU89	383 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	BCL11A	Q9H165	835 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	CABP5	Q9NP86	173 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	HTT	P42858	3142 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	CCNA1	P78396	465 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	GPR142	Q7Z601	462 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	AACS	Q86V21	672 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	PORCN	Q9H237	461 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	PTPRF	P10586	1907 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	USP17L15	C9J2P7	530 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	USP17L11	C9JVI0	530 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	USP17L18	D6R9N7	530 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	USP17L22	D6RA61	530 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	USP17L19	D6RCP7	530 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	USP17L20	D6RJB6	530 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	USP14	P54578	494 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	USP17L24	Q0WX57	530 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	LRCH3	Q96II8	777 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	CCL14	Q16627	93 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP36-223	ENST00000592326	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		13.72	□□□□□ -0.21

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