RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589550.1

PIK3C3-211, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3-211ENST00000589550 JDP2Q8WYK2 163 aa7.29□□□□□ -1.24
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PIK3C3-211ENST00000589550 KLHL3Q9UH77 587 aa7.29□□□□□ -1.24
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PIK3C3-211ENST00000589550 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.27□□□□□ -1.25
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PIK3C3-211ENST00000589550 FAM13CQ8NE31 585 aa7.26□□□□□ -1.25
PIK3C3-211ENST00000589550 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PIK3C3-211ENST00000589550 CDC6Q99741 560 aa7.26□□□□□ -1.25
PIK3C3-211ENST00000589550 A0A1W2PQU0 124 aa7.25□□□□□ -1.25
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM86C2PA6NEL3 165 aa7.25□□□□□ -1.25
PIK3C3-211ENST00000589550 H3BM21 787 aa7.25□□□□□ -1.25
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PIK3C3-211ENST00000589550 C12orf40Q86WS4 652 aa7.25□□□□□ -1.25
PIK3C3-211ENST00000589550 JAMLQ86YT9 394 aa7.25□□□□□ -1.25
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PIK3C3-211ENST00000589550 PHACTR4Q8IZ21 702 aa7.25□□□□□ -1.25
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PIK3C3-211ENST00000589550 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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PIK3C3-211ENST00000589550 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.25□□□□□ -1.25
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PIK3C3-211ENST00000589550 RGS13O14921 159 aa7.24□□□□□ -1.25
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PIK3C3-211ENST00000589550 NFKB2Q00653 900 aa7.24□□□□□ -1.25
PIK3C3-211ENST00000589550 MAP7Q14244 749 aa7.24□□□□□ -1.25
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC6A19Q695T7 634 aa7.24□□□□□ -1.25
PIK3C3-211ENST00000589550 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.24□□□□□ -1.25
PIK3C3-211ENST00000589550 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa7.24□□□□□ -1.25
PIK3C3-211ENST00000589550 RNF180Q86T96 592 aa7.24□□□□□ -1.25
PIK3C3-211ENST00000589550 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
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PIK3C3-211ENST00000589550 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.24□□□□□ -1.25
PIK3C3-211ENST00000589550 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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