RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 SALL1Q9NSC2 1324 aa7.26□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 FZD9O00144 591 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 GPAA1O43292 621 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 VIL1P09327 827 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 SLURP2P0DP57 97 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 BTDP43251 543 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 CRKP46108 304 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF6P56537 245 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 GRIPAP1Q4V328 841 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 STK11IPQ8N1F8 1099 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 SDR42E1Q8WUS8 393 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 APPBP2Q92624 585 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 ANO2Q9NQ90 1003 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 TAF6LQ9Y6J9 622 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC171Q6TFL3 1326 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 CLRN2A0PK11 232 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC10A3P09131 477 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP2D6P10635 497 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNMA1Q12791 1236 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 UBE3CQ15386 1083 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 CFAP100Q494V2 611 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 DLK2Q6UY11 383 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 GMLQ99445 158 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 PALD1Q9ULE6 856 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 ADGRG1Q9Y653 693 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 RFX7Q2KHR2 1363 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 OATP04181 439 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 EPS15P42566 896 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 HAND2P61296 217 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 PICALMQ13492 652 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 CASC1Q6TDU7 716 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 ZFPM1Q8IX07 1006 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 TRPM4Q8TD43 1214 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 AIDAQ96BJ3 306 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 VPS33BQ9H267 617 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 INCENPQ9NQS7 918 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 HELLSQ9NRZ9 838 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 TACC3Q9Y6A5 838 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 GAKO14976 1311 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 ECM29Q5VYK3 1845 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 NAV1Q8NEY1 1877 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 GSG1L2A8MUP6 293 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 HIP1O00291 1037 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 GRIN3BO60391 1043 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 APPP05067 770 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 USP17L8P0C7I0 530 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 RHBDL3P58872 404 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 TCP10Q12799 353 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 NFIAQ12857 509 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 TNIP1Q15025 636 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 NBPF9Q3BBW0 867 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 RUFY2Q8WXA3 655 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 TEKT1Q969V4 418 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 USP26Q9BXU7 913 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 USP40Q9NVE5 1235 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM196BA6NMK8 535 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 TCP10L2B9ZVM9 353 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 LDHCP07864 332 aa7.21□□□□□ -1.26
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