RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 PPIL2Q13356 520 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 DOCK1Q14185 1865 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 C12orf60Q5U649 245 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 CTR9Q6PD62 1173 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 IFNL1Q8IU54 200 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 AMOTL1Q8IY63 956 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 PHIPQ8WWQ0 1821 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 DYNLL2Q96FJ2 89 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 PTPN18Q99952 460 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 THSD7BQ9C0I4 1608 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 DNAJC18Q9H819 358 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 SERPINB13Q9UIV8 391 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 USP17L5A8MUK1 530 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 CA12O43570 354 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 CETPP11597 493 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 GNAT2P19087 354 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 SPP2Q13103 211 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 SNAPC2Q13487 334 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 TTC22Q5TAA0 569 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 GADL1Q6ZQY3 521 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 SKAP1Q86WV1 359 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 IFNL3Q8IZI9 196 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 BRI3BPQ8WY22 251 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM227BQ96M60 508 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 HELLSQ9NRZ9 838 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A0D9SFI3 127 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIM75PA6NK02 468 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 CXCL11O14625 94 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 GH2P01242 217 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 SHMT1P34896 483 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 TDO2P48775 406 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 CDK8P49336 464 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 RAB3GAP1Q15042 981 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 ABCB5Q2M3G0 1257 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 TATDN1Q6P1N9 297 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM43AQ8N2R8 423 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC44A5Q8NCS7 719 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 EHD4Q9H223 541 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 AS3MTQ9HBK9 375 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 CABP5Q9NP86 173 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 LAMB1P07942 1786 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 BTBD19C9JJ37 291 aa8.13□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 ALDH1A1P00352 501 aa8.13□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 ASNSP08243 561 aa8.13□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 GABPAQ06546 454 aa8.13□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 SBK1Q52WX2 424 aa8.13□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 VPS53Q5VIR6 699 aa8.13□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 GIMAP6Q6P9H5 292 aa8.13□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF280CQ8ND82 737 aa8.13□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 NACAP1Q9BZK3 213 aa8.13□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 NAPBQ9H115 298 aa8.13□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 MKNK2Q9HBH9 465 aa8.13□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa8.13□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 SAGE1Q9NXZ1 904 aa8.13□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP4R2Q9NY27 417 aa8.13□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 SWAP70Q9UH65 585 aa8.13□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa8.13□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNH4Q9UQ05 1017 aa8.13□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 PTPRFP10586 1907 aa8.12□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 GPR25O00155 361 aa8.12□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 HIP1O00291 1037 aa8.12□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 PDHXO00330 501 aa8.12□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 AKR1B1P15121 316 aa8.12□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 HMGCS2P54868 508 aa8.12□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.12□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 CRHR2Q13324 411 aa8.12□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 DGKZQ13574 1117 aa8.12□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 MOGSQ13724 837 aa8.12□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 SEPT2Q15019 361 aa8.12□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.12□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 C16orf86Q6ZW13 317 aa8.12□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 TICAM2Q86XR7 235 aa8.12□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR18Q9BV38 432 aa8.12□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa8.12□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 INCENPQ9NQS7 918 aa8.12□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 PRDM10Q9NQV6 1147 aa8.12□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 GINM1Q9NU53 330 aa8.12□□□□□ -1.11
EFTUD2-211ENST00000588374 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms