RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 TONSLQ96HA7 1378 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 MAPKBP1O60336 1514 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 PTPN23Q9H3S7 1636 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 FANCGO15287 622 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 BMP6P22004 513 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 FUT4P22083 530 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 SPRED2Q7Z698 418 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 KCT2Q8NC54 265 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 FRMD6Q96NE9 622 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 C12orf49Q9H741 205 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 GRIN2AQ12879 1464 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 NAIPQ13075 1403 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 FBXO24O75426 580 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 PAGE1O75459 146 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 OXCT1P55809 520 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 RING1Q06587 406 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 BNIP3Q12983 259 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 PPM1JQ5JR12 505 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 CDC37L1Q7L3B6 337 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 SYNJ2O15056 1496 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-215ENST00000583289 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 CCER2I3L3R5 266 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 USP17L7P0C7H9 530 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 CD8BP10966 210 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 NTF4P34130 210 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 FGD1P98174 961 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 AOC3Q16853 763 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 PCNX4Q63HM2 1172 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 SETDB2Q96T68 719 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 U3KQE9 123 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 PLEKHD1A6NEE1 506 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 PAPLNO95428 1278 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 P4HBP07237 508 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 CELA3AP09093 270 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 ITIH2P19823 946 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 OGFOD2Q6N063 350 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 SV2BQ7L1I2 683 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 C12orf40Q86WS4 652 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 SIN3AQ96ST3 1273 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 WWC3Q9ULE0 1092 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 CSADQ9Y600 493 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 KIAA0556O60303 1618 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 ANP32CO43423 234 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 LDHBP07195 334 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 ASB11Q8WXH4 323 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 DISP1Q96F81 1524 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 GCC2Q8IWJ2 1684 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 GNAT3A8MTJ3 354 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 LRIG2O94898 1065 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 RASIP1Q5U651 963 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 HDXQ7Z353 690 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 GNA15P30679 374 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 CLCN7P51798 805 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 NUP160Q12769 1436 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 PTPRKQ15262 1439 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 ITSN2Q9NZM3 1697 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 CD96P40200 585 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-215ENST00000583289 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.22□□□□□ -1.41
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