RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572085.5

TP53BP1-216, Transcript of tumor protein p53 binding protein 1, human

TSL 2

Gene TP53BP1, Length 5,574 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TP53BP1-216	ENST00000572085	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	PPP2R5D	Q14738	602 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	RDH13	Q8NBN7	331 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	BIN1	O00499	593 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	TRAK2	O60296	914 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	LIG4	P49917	911 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	SLC12A2	P55011	1212 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	SREBF2	Q12772	1141 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	MYCT1	Q8N699	235 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	UBXN4	Q92575	508 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	ARMT1	Q9H993	441 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	ITM2B	Q9Y287	266 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	URGCP	Q8TCY9	931 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	CDHR1	Q96JP9	859 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	NPAT	Q14207	1427 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	PSMD2	Q13200	908 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	TRIM50	Q86XT4	487 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	IL16	Q14005	1332 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TP53BP1-216	ENST00000572085	C21orf2	O43822	256 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	SORBS3	O60504	671 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	PDE6A	P16499	860 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	XKR9	Q5GH70	373 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	ST7	Q9NRC1	585 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	WDR64	B1ANS9	1081 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	TRAF5	O00463	557 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	ACTN1	P12814	892 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	PPP2R5C	Q13362	524 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	DHX58	Q96C10	678 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	CCDC17	Q96LX7	622 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	HACL1	Q9UJ83	578 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	PPFIA3	O75145	1194 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	NNMT	P40261	264 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	PALM2	Q8IXS6	379 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085		A0A1B0GUL7	405 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	EXOC3	O60645	756 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	USP17L8	P0C7I0	530 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	TNFAIP3	P21580	790 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	PPP2R5A	Q15172	486 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	FBXO11	Q86XK2	927 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	PGBD3	Q8N328	593 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	IQUB	Q8NA54	791 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	SMC6	Q96SB8	1091 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	USP17L3	A6NCW0	530 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	USP17L4	A6NCW7	530 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	NBPF26	B4DH59	902 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	DYNC1I1	O14576	645 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	SLFN5	Q08AF3	891 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	TTC1	Q99614	292 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	GJB2	P29033	226 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	SATB1	Q01826	763 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	MAP7	Q14244	749 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	DENND3	A2RUS2	1198 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	STX1A	Q16623	288 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TP53BP1-216	ENST00000572085	SPATA5	Q8NB90	893 aa		11.19	□□□□□ -0.62

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