RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563386.5

USP10-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 590 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-208ENST00000563386 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
USP10-208ENST00000563386 STAP2Q9UGK3 403 aa22.74■■□□□ 1.23
USP10-208ENST00000563386 GH2P01242 217 aa22.73■■□□□ 1.23
USP10-208ENST00000563386 SP3Q02447 781 aa22.73■■□□□ 1.23
USP10-208ENST00000563386 NUCB1Q02818 461 aa22.73■■□□□ 1.23
USP10-208ENST00000563386 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.73■■□□□ 1.23
USP10-208ENST00000563386 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.73■■□□□ 1.23
USP10-208ENST00000563386 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.73■■□□□ 1.23
USP10-208ENST00000563386 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.73■■□□□ 1.23
USP10-208ENST00000563386 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.73■■□□□ 1.23
USP10-208ENST00000563386 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
USP10-208ENST00000563386 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.72■■□□□ 1.23
USP10-208ENST00000563386 HMGCS2P54868 508 aa22.72■■□□□ 1.23
USP10-208ENST00000563386 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
USP10-208ENST00000563386 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.72■■□□□ 1.23
USP10-208ENST00000563386 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
USP10-208ENST00000563386 USP17L12C9JPN9 530 aa22.71■■□□□ 1.23
USP10-208ENST00000563386 USP17L21D6R901 530 aa22.71■■□□□ 1.23
USP10-208ENST00000563386 M0R2C6 588 aa22.71■■□□□ 1.23
USP10-208ENST00000563386 TLR2O60603 784 aa22.71■■□□□ 1.23
USP10-208ENST00000563386 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
USP10-208ENST00000563386 SHMT1P34896 483 aa22.71■■□□□ 1.23
USP10-208ENST00000563386 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.71■■□□□ 1.23
USP10-208ENST00000563386 ERO1AQ96HE7 468 aa22.71■■□□□ 1.23
USP10-208ENST00000563386 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.71■■□□□ 1.23
USP10-208ENST00000563386 CPA4Q9UI42 421 aa22.71■■□□□ 1.23
USP10-208ENST00000563386 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
USP10-208ENST00000563386 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 GPAA1O43292 621 aa22.7■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 CYP2C8P10632 490 aa22.7■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.7■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.7■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 CABP5Q9NP86 173 aa22.7■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 GINM1Q9NU53 330 aa22.7■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.69■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.69■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 APPP05067 770 aa22.69■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 MTMR2Q13614 643 aa22.69■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 TREML2Q5T2D2 321 aa22.69■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.69■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 EVI5LQ96CN4 794 aa22.69■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 WDR18Q9BV38 432 aa22.69■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 TRIM17Q9Y577 477 aa22.69■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 PTPRFP10586 1907 aa22.69■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 SMIM22K7EJ46 135 aa22.68■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 GABPAQ06546 454 aa22.68■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 C12orf60Q5U649 245 aa22.68■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.67■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 BACE1P56817 501 aa22.67■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.67■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 CTR9Q6PD62 1173 aa22.67■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.67■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.67■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 RILPL2Q969X0 211 aa22.67■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.67■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.67■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 USP17L10C9JJH3 530 aa22.66■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.66■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 FEZ1Q99689 392 aa22.66■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 EFCC1Q9HA90 598 aa22.66■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 SWAP70Q9UH65 585 aa22.66■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.65■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 GNAT2P19087 354 aa22.65■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 TDO2P48775 406 aa22.65■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 KIF22Q14807 665 aa22.65■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 C17orf99Q6UX52 265 aa22.65■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
USP10-208ENST00000563386 CDK8P49336 464 aa22.64■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 CAP1Q01518 475 aa22.64■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 SEPT2Q15019 361 aa22.64■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.64■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.64■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.64■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.64■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.63■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 C19orf81C9J6K1 198 aa22.63■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 ARHGEF6Q15052 776 aa22.63■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.63■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.63■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 OSBPP22059 807 aa22.62■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.62■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 ACER1Q8TDN7 264 aa22.62■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.62■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 PNMA3Q9UL41 463 aa22.62■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.62■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 AKR1B1P15121 316 aa22.61■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 GUCY1A2P33402 732 aa22.61■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.61■■□□□ 1.21
USP10-208ENST00000563386 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.8 ms