RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 C16orf86Q6ZW13 317 aa20.84■□□□□ 0.93
CCNDBP1-204ENST00000563065 WBP1LQ9NX94 342 aa20.84■□□□□ 0.93
CCNDBP1-204ENST00000563065 THSD7BQ9C0I4 1608 aa20.84■□□□□ 0.93
CCNDBP1-204ENST00000563065 INCENPQ9NQS7 918 aa20.83■□□□□ 0.93
CCNDBP1-204ENST00000563065 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.83■□□□□ 0.93
CCNDBP1-204ENST00000563065 DOCK1Q14185 1865 aa20.83■□□□□ 0.93
CCNDBP1-204ENST00000563065 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.82■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 ALX1Q15699 326 aa20.82■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 PTPN18Q99952 460 aa20.82■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.82■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.82■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.82■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRDM1O75626 825 aa20.81■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 AKR1B1P15121 316 aa20.81■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 GUCY1A2P33402 732 aa20.81■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 TM4SF4P48230 202 aa20.81■□□□□ 0.92
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CCNDBP1-204ENST00000563065 PPARAQ07869 468 aa20.81■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 ABCB5Q2M3G0 1257 aa20.81■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.81■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 SWAP70Q9UH65 585 aa20.81■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa20.81■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRIM75PA6NK02 468 aa20.81■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.81■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 ASNSP08243 561 aa20.81■□□□□ 0.92
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CCNDBP1-204ENST00000563065 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
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CCNDBP1-204ENST00000563065 SPP2Q13103 211 aa20.81■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCL15Q16663 113 aa20.81■□□□□ 0.92
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CCNDBP1-204ENST00000563065 KCNH4Q9UQ05 1017 aa20.81■□□□□ 0.92
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CCNDBP1-204ENST00000563065 USP17L5A8MUK1 530 aa20.8■□□□□ 0.92
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CCNDBP1-204ENST00000563065 HAND2P61296 217 aa20.8■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 PTH1RQ03431 593 aa20.8■□□□□ 0.92
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CCNDBP1-204ENST00000563065 DGKZQ13574 1117 aa20.8■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.8■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.8■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 RNF186Q9NXI6 227 aa20.8■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRPA1O75762 1119 aa20.79■□□□□ 0.92
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CCNDBP1-204ENST00000563065 SEPT2Q15019 361 aa20.79■□□□□ 0.92
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CCNDBP1-204ENST00000563065 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.79■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 CABP5Q9NP86 173 aa20.79■□□□□ 0.92
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CCNDBP1-204ENST00000563065 RAD50Q92878 1312 aa20.78■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 LAMB1P07942 1786 aa20.78■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 CXCL11O14625 94 aa20.77■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 CETPP11597 493 aa20.77■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 INHBEP58166 350 aa20.77■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.77■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 BEGAINQ9BUH8 593 aa20.77■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 DSCC1Q9BVC3 393 aa20.77■□□□□ 0.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 NBPF3Q9H094 633 aa20.77■□□□□ 0.92
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CCNDBP1-204ENST00000563065 ACER1Q8TDN7 264 aa20.76■□□□□ 0.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa20.76■□□□□ 0.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 WDR18Q9BV38 432 aa20.76■□□□□ 0.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.76■□□□□ 0.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa20.76■□□□□ 0.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 GINM1Q9NU53 330 aa20.76■□□□□ 0.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANAPC4Q9UJX5 808 aa20.76■□□□□ 0.91
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CCNDBP1-204ENST00000563065 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.75■□□□□ 0.91
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CCNDBP1-204ENST00000563065 CDC45O75419 566 aa20.75■□□□□ 0.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 TBC1D8O95759 1140 aa20.75■□□□□ 0.91
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CCNDBP1-204ENST00000563065 HMGCS2P54868 508 aa20.75■□□□□ 0.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.75■□□□□ 0.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMEM179Q6ZVK1 233 aa20.75■□□□□ 0.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.75■□□□□ 0.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 NKX2-3Q8TAU0 364 aa20.75■□□□□ 0.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC17Q96LX7 622 aa20.75■□□□□ 0.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.75■□□□□ 0.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZMYM6O95789 1325 aa20.74■□□□□ 0.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 A0A1W2PRG0 241 aa20.74■□□□□ 0.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 PDE4BQ07343 736 aa20.74■□□□□ 0.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 TBC1D10CQ8IV04 446 aa20.74■□□□□ 0.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
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