RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
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USP3-AS1-201ENST00000558831 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
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USP3-AS1-201ENST00000558831 HPS5Q9UPZ3 1129 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-201ENST00000558831 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.16■□□□□ 0.82
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USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM196BA6NMK8 535 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-201ENST00000558831 GOLGA8AA7E2F4 631 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-201ENST00000558831 CPLX1O14810 134 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLURP2P0DP57 97 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-201ENST00000558831 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-201ENST00000558831 SULF1Q8IWU6 871 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF654Q8IZM8 581 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-201ENST00000558831 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-201ENST00000558831 HOOK2Q96ED9 719 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-201ENST00000558831 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-201ENST00000558831 IL17RBQ9NRM6 502 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-201ENST00000558831 PGAP2Q9UHJ9 254 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-201ENST00000558831 SHMT1P34896 483 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-201ENST00000558831 NUCB2P80303 420 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-201ENST00000558831 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-201ENST00000558831 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-201ENST00000558831 TEPSINQ96N21 525 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-201ENST00000558831 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
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