RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556718.1

PRPF39-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF39, Length 499 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-210ENST00000556718 FGD1P98174 961 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 NKG7Q16617 165 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 DIRC2Q96SL1 478 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 MIPEPQ99797 713 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 CEP44Q9C0F1 390 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 SAMM50Q9Y512 469 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 ST14Q9Y5Y6 855 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 GDNFP39905 211 aa7.34□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 SFRP5Q5T4F7 317 aa7.34□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 ANKLE2Q86XL3 938 aa7.34□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 NPAS4Q8IUM7 802 aa7.34□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 MFSD4AQ8N468 514 aa7.34□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 KCT2Q8NC54 265 aa7.34□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa7.34□□□□□ -1.23
PRPF39-210ENST00000556718 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 CDK8P49336 464 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 LRRC14Q15048 493 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 PCNX4Q63HM2 1172 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 PPM1HQ9ULR3 514 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 CBX7O95931 251 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 MAPK1P28482 360 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 LILRA6Q6PI73 481 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 WWC3Q9ULE0 1092 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 CYP8B1Q9UNU6 501 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 NFIBO00712 420 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 MAPK8P45983 427 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 SIAH1Q8IUQ4 282 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 UBE2FQ969M7 185 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 SLAMF8Q9P0V8 285 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 ZSWIM5Q9P217 1185 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 ERVFC1P60507 584 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 LETMD1Q6P1Q0 360 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 XAGE3Q8WTP9 111 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 WASH4PA8MWX3 477 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 CAP2P40123 477 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 RALGPS1Q5JS13 557 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 HDXQ7Z353 690 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 TTC6Q86TZ1 520 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 MFSD2AQ8NA29 543 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 RGS22Q8NE09 1264 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF39-210ENST00000556718 TNK2Q07912 1038 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 CCDC27Q2M243 656 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 ATG14Q6ZNE5 492 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 TTLL10Q6ZVT0 673 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 THAP5Q7Z6K1 395 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 FBF1Q8TES7 1133 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 CD320Q9NPF0 282 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 CST3P01034 146 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 ESR1P03372 595 aa7.26□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 TMEM253P0C7T8 217 aa7.26□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 GRK4P32298 578 aa7.26□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 CDH24Q86UP0 819 aa7.26□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 HID1Q8IV36 788 aa7.26□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 ABHD4Q8TB40 342 aa7.26□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.26□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 EPB41L4BQ9H329 900 aa7.26□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 NCANO14594 1321 aa7.26□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 PRRG2O14669 202 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 USP17L7P0C7H9 530 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 HK2P52789 917 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 KCNA10Q16322 511 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa7.25□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 AMIGO3Q86WK7 504 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 CCDC120Q96HB5 630 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 C12orf49Q9H741 205 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 B8ZZF3 427 aa7.23□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 GIPC1O14908 333 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms