RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 DENND2AQ9ULE3 1009 aa17.07■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 TMEM265A0A087WTH1 108 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 TRIM43BA6NCK2 446 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 ITGB8P26012 769 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 BACE1P56817 501 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 RASGRF1Q13972 1273 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 PAGR1Q9BTK6 254 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 SIL1Q9H173 461 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 ABCF2Q9UG63 623 aa17.06■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 DNM1LO00429 736 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 CNMDO75829 334 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 MAP2K5Q13163 448 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 TRIM60Q495X7 471 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 LPAR1Q92633 364 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 WDR18Q9BV38 432 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 USP44Q9H0E7 712 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 PDLIM7Q9NR12 457 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 CNGA1P29973 690 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 CYP2C19P33261 490 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 MECOMQ03112 1051 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 ANO1Q5XXA6 986 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 CCDC102BQ68D86 513 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 NPLOC4Q8TAT6 608 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 FAM122AQ96E09 287 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 TBC1D2Q9BYX2 928 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 BDP1A6H8Y1 2624 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 SEMA3EO15041 775 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 DNAJC18Q9H819 358 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 AS3MTQ9HBK9 375 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 TMOD4Q9NZQ9 345 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 NPM3O75607 178 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 IGHA2P01877 340 aa17.02■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 WDR63Q8IWG1 891 aa17.02■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 EMILIN3Q9NT22 766 aa17.02■□□□□ 0.32
CS-230ENST00000551968 REV3LO60673 3130 aa17.01■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 CHD9Q3L8U1 2897 aa17.01■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 MAP3K12Q12852 859 aa17.01■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 SNX17Q15036 470 aa17.01■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 MFSD14CQ5VZR4 134 aa17.01■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 PPM1EQ8WY54 764 aa17.01■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa17.01■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 GDF11O95390 407 aa17■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 CYBAP13498 195 aa17■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa17■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 FERMT2Q96AC1 680 aa17■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 CEP126Q9P2H0 1117 aa17■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 ZBTB22O15209 634 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 PTPREP23469 700 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 DNAJB2P25686 324 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 TIMM10P62072 90 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 PI16Q6UXB8 463 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 SLF2Q8IX21 1173 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 SLC15A5A6NIM6 579 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 C19orf81C9J6K1 198 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 USP17L10C9JJH3 530 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 MSCO60682 206 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 CIAO1O76071 339 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 ADCYAP1R1P41586 468 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 ATP2B2Q01814 1243 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 WDR78Q5VTH9 848 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 ERICH6Q7L0X2 663 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 ASB2Q96Q27 587 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 BTBD7Q9P203 1132 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 ASNSP08243 561 aa16.97■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 HOXC6P09630 235 aa16.97■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 TLE2Q04725 743 aa16.97■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 GRB14Q14449 540 aa16.97■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 TEX11Q8IYF3 940 aa16.97■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 ZNF576Q9H609 170 aa16.97■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 NCOR1O75376 2440 aa16.97■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 XIRP2A4UGR9 3374 aa16.97■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa16.97■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa16.96■□□□□ 0.31
CS-230ENST00000551968 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms