RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 SPP2Q13103 211 aa21.39■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 C17orf99Q6UX52 265 aa21.39■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 SMC5Q8IY18 1101 aa21.39■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 WDR18Q9BV38 432 aa21.39■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 MCM9Q9NXL9 1143 aa21.39■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.39■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa21.39■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 TRIM17Q9Y577 477 aa21.39■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 CCDC85CA6NKD9 419 aa21.38■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 CYP2D6P10635 497 aa21.38■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 SHMT1P34896 483 aa21.38■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 SH3D19Q5HYK7 790 aa21.38■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 AS3MTQ9HBK9 375 aa21.38■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa21.38■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa21.38■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 IGHDP01880 384 aa21.37■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 CYP2C8P10632 490 aa21.37■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 HMGCS2P54868 508 aa21.37■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 TREML2Q5T2D2 321 aa21.37■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 APPBP2Q92624 585 aa21.37■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 CPA4Q9UI42 421 aa21.37■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 GH2P01242 217 aa21.36■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 OSBP2Q969R2 916 aa21.36■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
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CS-219ENST00000550655 STAP2Q9UGK3 403 aa21.36■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 BCRP11274 1271 aa21.35■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 MTMR2Q13614 643 aa21.35■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.35■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.35■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 SMIM22K7EJ46 135 aa21.34■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 CTGFP29279 349 aa21.34■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 PDE1AP54750 535 aa21.34■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 BACE1P56817 501 aa21.34■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 SLC44A5Q8NCS7 719 aa21.34■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 PTPN22Q9Y2R2 807 aa21.34■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa21.33■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 M0R2C6 588 aa21.33■■□□□ 1.01
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CS-219ENST00000550655 C12orf60Q5U649 245 aa21.33■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 LNPKQ9C0E8 428 aa21.33■■□□□ 1.01
CS-219ENST00000550655 USP17L12C9JPN9 530 aa21.32■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 USP17L21D6R901 530 aa21.32■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 GUCY1A2P33402 732 aa21.32■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 DYNLL2Q96FJ2 89 aa21.32■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 FSD1Q9BTV5 496 aa21.32■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.32■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.31■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 USP17L10C9JJH3 530 aa21.31■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 GPAA1O43292 621 aa21.31■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.31■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 SWAP70Q9UH65 585 aa21.31■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 C19orf81C9J6K1 198 aa21.3■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 NUCB1Q02818 461 aa21.3■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 KIF22Q14807 665 aa21.3■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.3■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 CTR9Q6PD62 1173 aa21.3■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 CHD1LQ86WJ1 897 aa21.3■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 TRIM47Q96LD4 638 aa21.3■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 PNMA3Q9UL41 463 aa21.3■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 ROBO3Q96MS0 1386 aa21.29■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP21.29■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 ARHGEF6Q15052 776 aa21.29■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.29■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.29■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 C16orf86Q6ZW13 317 aa21.29■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.29■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 CABP5Q9NP86 173 aa21.29■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 EMILIN3Q9NT22 766 aa21.29■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 TMOD4Q9NZQ9 345 aa21.29■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 CENPFP49454 3210 aa21.29■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 SEPT2Q15019 361 aa21.28■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 AMOTL1Q8IY63 956 aa21.28■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 ACER1Q8TDN7 264 aa21.28■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 C12orf42Q96LP6 360 aa21.28■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa21.28■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 PARP14Q460N5 1801 aa21.27■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 GNRH1P01148 92 aa21.27■■□□□ 1
CS-219ENST00000550655 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
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