RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549589.5

VEZT-222, Transcript of vezatin, adherens junctions transmembrane protein, human

TSL 4

Gene VEZT, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VEZT-222	ENST00000549589	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		12.88	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	DEFB118	Q96PH6	123 aa		12.88	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		12.88	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		12.87	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	DPYSL4	O14531	572 aa		12.87	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	INHA	P05111	366 aa		12.87	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	NFIA	Q12857	509 aa		12.87	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	MTX1	Q13505	466 aa		12.87	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		12.87	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		12.87	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		12.87	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		12.87	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		12.86	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		12.86	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		12.86	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	LNPK	Q9C0E8	428 aa		12.86	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	USP40	Q9NVE5	1235 aa		12.86	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		12.86	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		12.86	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	CAPN2	P17655	700 aa		12.85	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	IRF5	Q13568	498 aa		12.85	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	C8orf34	Q49A92	452 aa		12.85	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		12.85	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		12.85	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	PICK1	Q9NRD5	415 aa		12.85	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		12.85	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	PLXNB2	O15031	1838 aa		12.85	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		12.84	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		12.84	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	FGFR2	P21802	821 aa		12.84	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		12.84	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
VEZT-222	ENST00000549589	SLC5A1	P13866	664 aa		12.83	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	PTPRA	P18433	802 aa		12.83	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	PRDX5	P30044	214 aa		12.83	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	BMP8B	P34820	402 aa		12.83	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		12.83	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	COA7	Q96BR5	231 aa		12.83	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	GDF15	Q99988	308 aa		12.83	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		12.83	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		12.83	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	SRGAP3	O43295	1099 aa		12.82	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	RAB11FIP3	O75154	756 aa		12.82	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		12.82	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	DEFB123	Q8N688	67 aa		12.82	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		12.82	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	LPIN2	Q92539	896 aa		12.82	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		12.81	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	TRIM75P	A6NK02	468 aa		12.81	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	EYA2	O00167	538 aa		12.81	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	TBC1D12	O60347	775 aa		12.81	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	ENTPD3	O75355	529 aa		12.81	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589		Q7L0L9	218 aa		12.81	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		12.81	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	NUDT7	P0C024	238 aa		12.8	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	SLURP2	P0DP57	97 aa		12.8	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	SYN1	P17600	705 aa		12.8	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		12.8	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		12.8	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		12.8	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	IDI2	Q9BXS1	227 aa		12.8	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		12.8	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		12.8	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	TREML2	Q5T2D2	321 aa		12.79	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		12.79	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	NBPF3	Q9H094	633 aa		12.79	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	PNMA3	Q9UL41	463 aa		12.79	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		12.79	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		12.79	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	HMGCR	P04035	888 aa		12.78	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
VEZT-222	ENST00000549589	MAP3K10	Q02779	954 aa		12.78	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms