RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547541.1

TARBP2-208, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, human

TSL 3

Gene TARBP2, Length 430 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP2-208	ENST00000547541	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
TARBP2-208	ENST00000547541	STK36	Q9NRP7	1315 aa		11.78	□□□□□ -0.52
TARBP2-208	ENST00000547541	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		11.78	□□□□□ -0.52
TARBP2-208	ENST00000547541	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
TARBP2-208	ENST00000547541	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		11.77	□□□□□ -0.52
TARBP2-208	ENST00000547541	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541		H3BQV1	296 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	TSPY3	P0CV98	308 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	TSPY8	P0CW00	308 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	NOV	P48745	357 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	CXCL9	Q07325	125 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	NTRK3	Q16288	839 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	RTN1	Q16799	776 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	IFFO2	Q5TF58	517 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	CCDC17	Q96LX7	622 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	SENP2	Q9HC62	589 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	SCN9A	Q15858	1988 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	UTRN	P46939	3433 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	RAD17	O75943	681 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	CDC27	P30260	824 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	TROAP	Q12815	778 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	PICALM	Q13492	652 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	DLGAP5	Q15398	846 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	ATL3	Q6DD88	541 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	MICU3	Q86XE3	530 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	KLHL34	Q8N239	644 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	DPF2	Q92785	391 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	DDX11	Q96FC9	970 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	FZD9	O00144	591 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	SPDYE6	P0CI01	402 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	KIF5B	P33176	963 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	GNAQ	P50148	359 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	EVX2	Q03828	476 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	MCTP1	Q6DN14	999 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	KAT14	Q9H8E8	782 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	MYO1B	O43795	1136 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	TRAK2	O60296	914 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	SMARCA1	P28370	1054 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	FAM151A	Q8WW52	585 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	C8orf76	Q96K31	380 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	COL4A5	P29400	1685 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	MYH1	P12882	1939 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	DEXI	O95424	95 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	NFIA	Q12857	509 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	NBPF11	Q86T75	865 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	FAM83A	Q86UY5	434 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	MYL10	Q9BUA6	226 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53

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